268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  69.57 
 
 
484 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  80.79 
 
 
484 aa  787    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  71.07 
 
 
483 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  79.96 
 
 
484 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  80.58 
 
 
484 aa  791    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  82.02 
 
 
484 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  69.98 
 
 
484 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  98.35 
 
 
484 aa  952    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  67.98 
 
 
483 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  81.2 
 
 
484 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  81.2 
 
 
484 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  70.6 
 
 
484 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  80.79 
 
 
484 aa  779    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 
484 aa  966    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  70.81 
 
 
484 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 
484 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  52.18 
 
 
481 aa  488  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.35 
 
 
481 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  51.14 
 
 
480 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  51.77 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  53.28 
 
 
480 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  51.25 
 
 
480 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  50 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 
480 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  49.38 
 
 
480 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  49.17 
 
 
480 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  50.42 
 
 
480 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  55.28 
 
 
493 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  47.62 
 
 
481 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  47.81 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  48.94 
 
 
472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  46.46 
 
 
481 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  46.52 
 
 
498 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  45.11 
 
 
485 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  42.18 
 
 
482 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  39.75 
 
 
482 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  38.76 
 
 
482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.96 
 
 
498 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  38.92 
 
 
466 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  38.89 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  38.9 
 
 
500 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  39.45 
 
 
466 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  38.34 
 
 
484 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  37.09 
 
 
482 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  36.12 
 
 
482 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  35.48 
 
 
482 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  38.8 
 
 
510 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  35.48 
 
 
482 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  34.66 
 
 
478 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  37.94 
 
 
484 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.73 
 
 
484 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.49 
 
 
483 aa  289  9e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.81 
 
 
483 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  35.16 
 
 
481 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.44 
 
 
483 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.82 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.17 
 
 
485 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.85 
 
 
491 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.14 
 
 
488 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.47 
 
 
488 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  36.21 
 
 
484 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  40.6 
 
 
484 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.96 
 
 
485 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.04 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.36 
 
 
483 aa  272  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  42.61 
 
 
484 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.55 
 
 
485 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.06 
 
 
486 aa  271  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  33.97 
 
 
479 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.89 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  35.82 
 
 
483 aa  270  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.23 
 
 
498 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.32 
 
 
479 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.42 
 
 
485 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.19 
 
 
481 aa  267  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.56 
 
 
498 aa  266  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.32 
 
 
485 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.81 
 
 
483 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.66 
 
 
483 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.34 
 
 
482 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  34.84 
 
 
466 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  35.43 
 
 
483 aa  264  3e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  35.11 
 
 
483 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  35.51 
 
 
479 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  36.15 
 
 
483 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  34.69 
 
 
487 aa  263  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.32 
 
 
485 aa  263  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.76 
 
 
485 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  35.17 
 
 
476 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  34.52 
 
 
486 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.66 
 
 
488 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.5 
 
 
485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.54 
 
 
482 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>