260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1801 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  69.57 
 
 		 484 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  84.5 
 
 		 484 aa  811    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  85.12 
 
 		 484 aa  815    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  79.55 
 
 		 484 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 		 484 aa  966    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  84.71 
 
 		 484 aa  800    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  98.76 
 
 		 484 aa  956    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  83.88 
 
 		 484 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  86.98 
 
 		 484 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  69.77 
 
 		 484 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  69.57 
 
 		 484 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  79.96 
 
 		 484 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 		 484 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 		 484 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  71.69 
 
 		 483 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  67.56 
 
 		 483 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  50.83 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  51.88 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.04 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  51.57 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  49.17 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  48.75 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  48.75 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.75 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  48.75 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  49.17 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  48.54 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.54 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  49.58 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  48.54 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  48.74 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.48 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  48.12 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.13 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  46.97 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  47.3 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  52.01 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  46.92 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  38 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  40.37 
 
 		 482 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  41.79 
 
 		 485 aa  358  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.57 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  37.58 
 
 		 482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  39.67 
 
 		 500 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  39.78 
 
 		 466 aa  350  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.42 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  40.26 
 
 		 466 aa  342  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  37.11 
 
 		 484 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.39 
 
 		 482 aa  300  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.89 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.21 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.97 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.71 
 
 		 483 aa  292  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.46 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  38.2 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  34.23 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  34.23 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  35.52 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.39 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.86 
 
 		 485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.85 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.22 
 
 		 479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.65 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.44 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.64 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.19 
 
 		 485 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.17 
 
 		 483 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.11 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.77 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.65 
 
 		 483 aa  277  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.08 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.99 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.17 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.5 
 
 		 498 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.5 
 
 		 485 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  35.97 
 
 		 484 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.57 
 
 		 482 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  40.99 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  42.03 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.54 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  36.02 
 
 		 494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  35.23 
 
 		 486 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.91 
 
 		 479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.08 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.28 
 
 		 482 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.74 
 
 		 481 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  35.51 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.93 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.11 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  35.98 
 
 		 488 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.06 
 
 		 486 aa  266  5e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.61 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.78 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.26 
 
 		 491 aa  266  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.92 
 
 		 485 aa  266  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  35.98 
 
 		 488 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.31 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.46 
 
 		 485 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>