223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1935 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  67.22 
 
 		 482 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  100 
 
 		 482 aa  952    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  63.28 
 
 		 482 aa  621  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  48.86 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  54.1 
 
 		 484 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  54.1 
 
 		 484 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  53.67 
 
 		 484 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  46.89 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  46.89 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  44.4 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  43.53 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  43.78 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  43.98 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  46.78 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  41.41 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  44.61 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  41.75 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.12 
 
 		 490 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  41.46 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  42.56 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  42.71 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  42.71 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  42.51 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  43.09 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  42.68 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  42.68 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  42.68 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  42.68 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  42.21 
 
 		 480 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  44.21 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  43.75 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  42.77 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  44.07 
 
 		 498 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  42.56 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  45.71 
 
 		 472 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  41.24 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  43.21 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  48.96 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  43.06 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 484 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  40.52 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  39.61 
 
 		 484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  41.16 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  42.18 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  41.39 
 
 		 480 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  41.89 
 
 		 484 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  41.68 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  40.76 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  44.35 
 
 		 498 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  40.76 
 
 		 484 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  39.75 
 
 		 481 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.48 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.47 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  43.38 
 
 		 466 aa  339  5e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  39.91 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.46 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  40.62 
 
 		 510 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  42.07 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.39 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.08 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.02 
 
 		 488 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  38.65 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  37.03 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.22 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.01 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  38.11 
 
 		 483 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.82 
 
 		 485 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.46 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.77 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  39.59 
 
 		 483 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  34.6 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  35.43 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.35 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.31 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  37.71 
 
 		 482 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  37.29 
 
 		 483 aa  280  6e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  36.36 
 
 		 485 aa  279  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.85 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.6 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  38.57 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.81 
 
 		 485 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  38.63 
 
 		 487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.75 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.3 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  37.15 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.55 
 
 		 481 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.79 
 
 		 485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  38.41 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.31 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.03 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.57 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  37.65 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.38 
 
 		 485 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  37.21 
 
 		 483 aa  266  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 		 485 aa  266  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 		 485 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 		 485 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  37.68 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.27 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>