222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00395 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  100 
 
 
481 aa  956    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  83.16 
 
 
481 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  96.47 
 
 
481 aa  935    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  60 
 
 
480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  60.67 
 
 
481 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  59.38 
 
 
480 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  57.71 
 
 
480 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  58.13 
 
 
480 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  57.5 
 
 
480 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  57.5 
 
 
480 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  57.5 
 
 
480 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  57.5 
 
 
480 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  56.88 
 
 
480 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  58.13 
 
 
480 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  57.5 
 
 
480 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  57.5 
 
 
480 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  57.5 
 
 
480 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  57.29 
 
 
480 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  58.96 
 
 
480 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  53.33 
 
 
483 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  52.19 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 
484 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  52.46 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  52.82 
 
 
484 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  52.46 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  52.25 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  52.25 
 
 
484 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  53.54 
 
 
483 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  52.82 
 
 
484 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  52.25 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  52.46 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  52.03 
 
 
484 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  51.77 
 
 
484 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  51.77 
 
 
484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  47.36 
 
 
472 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  46.36 
 
 
481 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.78 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  51.91 
 
 
493 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  47.68 
 
 
490 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  41.29 
 
 
482 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.46 
 
 
482 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  45.08 
 
 
498 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  41.68 
 
 
485 aa  352  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.74 
 
 
498 aa  352  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.69 
 
 
500 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.72 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  37.55 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.78 
 
 
466 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  40.17 
 
 
483 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  38.48 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  39.4 
 
 
466 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  38.68 
 
 
484 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.06 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  38.16 
 
 
485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  36.8 
 
 
491 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  38.49 
 
 
481 aa  309  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.14 
 
 
482 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  42.49 
 
 
510 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.38 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.3 
 
 
488 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  38.64 
 
 
484 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.64 
 
 
478 aa  299  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.02 
 
 
482 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.02 
 
 
482 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.91 
 
 
483 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  39.38 
 
 
484 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  39.38 
 
 
484 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.35 
 
 
488 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.03 
 
 
485 aa  294  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  37.27 
 
 
483 aa  294  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.76 
 
 
483 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  38.7 
 
 
482 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  42.66 
 
 
484 aa  289  9e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.68 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  40 
 
 
478 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.09 
 
 
498 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  38 
 
 
482 aa  286  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.96 
 
 
485 aa  285  9e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.68 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  36.81 
 
 
488 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.81 
 
 
488 aa  282  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.14 
 
 
485 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.05 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  33.26 
 
 
479 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  36.21 
 
 
483 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.15 
 
 
486 aa  280  5e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.66 
 
 
485 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  37.09 
 
 
482 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  34.5 
 
 
479 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.73 
 
 
491 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  35.89 
 
 
494 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  37.18 
 
 
486 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.04 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  37.27 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.94 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  36.94 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  36.94 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.86 
 
 
466 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  37.11 
 
 
481 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>