239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0020 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  93.96 
 
 		 480 aa  895    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  81.88 
 
 		 480 aa  786    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  92.29 
 
 		 480 aa  883    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  93.96 
 
 		 480 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  93.96 
 
 		 480 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  93.54 
 
 		 480 aa  894    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  93.54 
 
 		 480 aa  893    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  75 
 
 		 480 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 		 480 aa  808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  93.54 
 
 		 480 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  78.54 
 
 		 480 aa  781    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  81.25 
 
 		 480 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  93.96 
 
 		 480 aa  895    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  83.75 
 
 		 480 aa  810    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 480 aa  964    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  57.59 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  57.5 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  57.29 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  56.39 
 
 		 481 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  55.65 
 
 		 483 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  55 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  54.64 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  54.07 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  53.38 
 
 		 484 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  53.44 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  54.28 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  51.18 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  51.18 
 
 		 484 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  51.25 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  51.41 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  51.63 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  51.04 
 
 		 484 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  50.54 
 
 		 484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  49.68 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  49.46 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  49.15 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  47.86 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.96 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.09 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  41.2 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  48.89 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.37 
 
 		 482 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  40.96 
 
 		 485 aa  359  7e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.18 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  41.16 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.78 
 
 		 466 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  41.3 
 
 		 500 aa  335  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  43.92 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.46 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.74 
 
 		 466 aa  319  7e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  37.34 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.98 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.98 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.13 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  39.12 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  38.95 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  37.89 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  38.51 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.68 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  37.5 
 
 		 484 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.92 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  34.77 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.86 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  38.2 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.74 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.98 
 
 		 485 aa  287  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  36.1 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.93 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.79 
 
 		 483 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.37 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  33.26 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  34.91 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.76 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.06 
 
 		 483 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.79 
 
 		 498 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  37.29 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  36.63 
 
 		 484 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  34.36 
 
 		 485 aa  276  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  38.35 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.76 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  35.38 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  34.82 
 
 		 498 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.37 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  34.36 
 
 		 491 aa  273  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.17 
 
 		 485 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  35.38 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  35 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  34.66 
 
 		 482 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.01 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.31 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  35.03 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.91 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.53 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.79 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  33.06 
 
 		 485 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  35.22 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.43 
 
 		 487 aa  263  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.2 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.07 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  36.24 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>