234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0017 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 		 482 aa  963    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  61 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  63.28 
 
 		 482 aa  601  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  60.25 
 
 		 483 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  58.51 
 
 		 483 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  58.18 
 
 		 483 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  55.58 
 
 		 483 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  56.31 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  56.4 
 
 		 485 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  56.64 
 
 		 483 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  54.75 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  55.26 
 
 		 485 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  55.58 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  55.58 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  54.64 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  55.58 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  54.64 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  54.64 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  53.61 
 
 		 485 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  54.64 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  54.43 
 
 		 486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  54.02 
 
 		 485 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  54.23 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  53.61 
 
 		 485 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  52.78 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  54 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  53 
 
 		 481 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  52.86 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  54.04 
 
 		 484 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  55.17 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  54.24 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  54.15 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  52.8 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  53 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  53 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  53 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  53 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  53 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  53.21 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  53.21 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  55.05 
 
 		 485 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  53.1 
 
 		 485 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  53.93 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  54.24 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  52.38 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  53.83 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  53.83 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  53.62 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  49.89 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  47.49 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  46.01 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  47.3 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  46.88 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  48.12 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  47.33 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  42.98 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  44.28 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  44.92 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  39.41 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  44.95 
 
 		 498 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  44.4 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  44.4 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  43.21 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  45.37 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  45.73 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.5 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  43.63 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  39.26 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  42.09 
 
 		 482 aa  348  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  39.38 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.03 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  39.27 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  41.48 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.41 
 
 		 494 aa  338  9e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.61 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.7 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  38.35 
 
 		 477 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  39.15 
 
 		 491 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.83 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  37.76 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  39 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  38.7 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  38.49 
 
 		 481 aa  308  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  38.19 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  40 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  41.05 
 
 		 478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.84 
 
 		 480 aa  302  8.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36.01 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  37.71 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  39.59 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  37.2 
 
 		 484 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>