242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0088 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  100 
 
 		 480 aa  958    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  40.98 
 
 		 481 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  43.16 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  43.25 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  42.69 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.83 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  40.88 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  41.13 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  39.17 
 
 		 482 aa  339  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  38.85 
 
 		 482 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  39.05 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  40.05 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  39.48 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  36.96 
 
 		 482 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  38.17 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  38.84 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  38.11 
 
 		 485 aa  323  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  35.89 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  38.81 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  41.2 
 
 		 486 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  37.14 
 
 		 483 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.04 
 
 		 491 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.74 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  37.18 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  39.16 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.44 
 
 		 484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  39.62 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.88 
 
 		 485 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  40.37 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.65 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  37.82 
 
 		 483 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.57 
 
 		 488 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.17 
 
 		 483 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  36.03 
 
 		 524 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  37.76 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  39.09 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.04 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.89 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  41.69 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  39.62 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  35.65 
 
 		 485 aa  296  7e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.64 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.93 
 
 		 485 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.12 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  39.62 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  39.14 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.17 
 
 		 483 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  36.21 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.59 
 
 		 488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  39.86 
 
 		 485 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.22 
 
 		 483 aa  289  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.15 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  36.59 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  39.35 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.2 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.97 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.1 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  40.37 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.13 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  37.99 
 
 		 484 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  40.37 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  34.69 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  36.63 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  32.99 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  39.77 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  39.91 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  39.77 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  39.91 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  39.91 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  39.91 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  39.77 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  33.75 
 
 		 485 aa  272  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  32.49 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  35.73 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  37.9 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  34.81 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  39.19 
 
 		 483 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  39.19 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1591  cation uptake protein  37.83 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0311  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.36 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.766234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  31.91 
 
 		 484 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  33.4 
 
 		 480 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  37.22 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  34.45 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  38.48 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  39.63 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  39.39 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  39.39 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  39.39 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  39.39 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  39.39 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  32.49 
 
 		 482 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  35.87 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  33.62 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  31.98 
 
 		 484 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  38.69 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  33.62 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  37.34 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  37.34 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>