250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0186 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  100 
 
 		 483 aa  966    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  59.63 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  54.66 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  56.52 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  56.88 
 
 		 485 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  56.31 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  57.73 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  55.53 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  56.61 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  56.49 
 
 		 485 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  55.58 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  56.73 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  58.09 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  58.09 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  55.88 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  58.09 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  56.11 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  55.19 
 
 		 483 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  57.96 
 
 		 486 aa  528  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  56.81 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  55.05 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  57.45 
 
 		 485 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  57.45 
 
 		 485 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  57.45 
 
 		 485 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  57.45 
 
 		 485 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  55.81 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  52.17 
 
 		 481 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  53.39 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  55.26 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  55.26 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  53.62 
 
 		 483 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  55.26 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  54.85 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  52.59 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  53.42 
 
 		 483 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  53.42 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  53.42 
 
 		 483 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  52.8 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  52.38 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  52.38 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  52.59 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  51.43 
 
 		 488 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  52.38 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  52.38 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  52.59 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  52.38 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  54.04 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  53.83 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  53.83 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  53.62 
 
 		 483 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  50.11 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  46.46 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  43.72 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  46.7 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  45.17 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  44.89 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  45 
 
 		 485 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  45.4 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  41.34 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  44.63 
 
 		 488 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  45.7 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  41.08 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  41.47 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  44.87 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  42.03 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  41.82 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  41.82 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  44.61 
 
 		 481 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  45.71 
 
 		 484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.82 
 
 		 479 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  44.33 
 
 		 482 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  43.24 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.74 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  42.24 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  38.81 
 
 		 478 aa  339  5e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.21 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  41.05 
 
 		 498 aa  326  7e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.9 
 
 		 479 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.25 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.44 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  35.88 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  37.3 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  37.27 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  38.28 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.32 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  36.23 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  39.38 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.96 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  38.43 
 
 		 485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.2 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  39.55 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  36.99 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  40.6 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  36.89 
 
 		 479 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>