224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1969 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  100 
 
 		 482 aa  958    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  64.11 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  63.69 
 
 		 481 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  56.22 
 
 		 482 aa  528  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  46.89 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  51.24 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  46.15 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  46.65 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  52.47 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  48.7 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  43.42 
 
 		 482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  45.28 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  45.81 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  42.62 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  45.26 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  42.5 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  41.77 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  44.26 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  42.45 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  44.09 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  42.06 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  44.33 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  47.93 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  42.8 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  42.17 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  46.07 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  46.07 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  41.77 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  47.73 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  47.73 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  43.33 
 
 		 485 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  38.8 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  46.15 
 
 		 483 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  42.09 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  43.66 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  42.62 
 
 		 491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  41.75 
 
 		 485 aa  362  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  41.82 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  45.85 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  43.07 
 
 		 486 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  45.66 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  45.87 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  46.78 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  40.41 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  46.07 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  40.54 
 
 		 479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  40.79 
 
 		 485 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  41.92 
 
 		 485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  42.42 
 
 		 485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  44.91 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  42.07 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  41.86 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  41.86 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  42.21 
 
 		 485 aa  352  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  45.61 
 
 		 485 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  39.96 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  40.08 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  40.41 
 
 		 487 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  41.6 
 
 		 485 aa  349  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  40.53 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  41.01 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  41.01 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  41.01 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  41.1 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  41.01 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  42.2 
 
 		 482 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  42.44 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  40.33 
 
 		 481 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  41.29 
 
 		 488 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.82 
 
 		 485 aa  342  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  41.1 
 
 		 485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  40.12 
 
 		 481 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  42.36 
 
 		 485 aa  335  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  40.51 
 
 		 483 aa  336  7e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  42.3 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  41.51 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  39.71 
 
 		 481 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  39.84 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  39.31 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  39.96 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  38.94 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  41.93 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  41.46 
 
 		 485 aa  320  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  38.29 
 
 		 510 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  40.29 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  41.77 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  36.82 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  36.72 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>