232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3184 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  100 
 
 		 483 aa  953    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  43.01 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  43.16 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  40.3 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  39.71 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  39.29 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.76 
 
 		 477 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  38.59 
 
 		 481 aa  359  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  39.67 
 
 		 483 aa  352  8e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  41.25 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  38.24 
 
 		 485 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  35.63 
 
 		 491 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  38.17 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  38.8 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  39.03 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  39.21 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  38.72 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  37.24 
 
 		 485 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  38.28 
 
 		 482 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  40 
 
 		 483 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0311  Trk-type K+ transport system, membrane component  39.63 
 
 		 479 aa  329  6e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.766234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  38.72 
 
 		 481 aa  329  9e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  38.72 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.7 
 
 		 485 aa  326  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.26 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.49 
 
 		 487 aa  326  7e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  39.39 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  37.53 
 
 		 485 aa  323  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  38.17 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  34.65 
 
 		 524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1591  cation uptake protein  40.9 
 
 		 475 aa  315  9e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.73 
 
 		 482 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.32 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.12 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  34.86 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.24 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.24 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.12 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  36.21 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  37.58 
 
 		 485 aa  296  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.89 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  37.65 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  32.73 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  33.68 
 
 		 483 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  33.69 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  32.51 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.42 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.42 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.98 
 
 		 481 aa  287  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.08 
 
 		 482 aa  286  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.01 
 
 		 485 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  33.66 
 
 		 512 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  35.39 
 
 		 485 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  36.34 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  35.33 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  35.26 
 
 		 483 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  33.33 
 
 		 514 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  35.26 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  32.16 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 		 483 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.05 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  33.2 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  34.05 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  34 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.62 
 
 		 485 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.62 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  35.62 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  36.71 
 
 		 494 aa  273  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  34.44 
 
 		 484 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  33.05 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  35.67 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  35.41 
 
 		 485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  35.41 
 
 		 485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.41 
 
 		 485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.41 
 
 		 485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  34.22 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  32.83 
 
 		 484 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  33.61 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  35.41 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  36.08 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  36.08 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  33.55 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  36.08 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  36.08 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  36.08 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  31.36 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  32.09 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  32.17 
 
 		 487 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  35.88 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.19 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  34.46 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  35.67 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  34.5 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  35.07 
 
 		 484 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.96 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.96 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  31.47 
 
 		 482 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  35.54 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  36.08 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>