222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2477 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  83.16 
 
 		 481 aa  827    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  82.74 
 
 		 481 aa  823    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 		 481 aa  960    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  59.67 
 
 		 480 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  58.84 
 
 		 480 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  58 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  58.21 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  57.29 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  58.21 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  58.21 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  58.21 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  58.84 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  58.21 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  58.21 
 
 		 480 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  57.59 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  57.8 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  58 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  57.32 
 
 		 481 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  57.8 
 
 		 480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  53.75 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  51.82 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  54.07 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  53.03 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  52.03 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  53.44 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  50.96 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  54.28 
 
 		 484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  50.96 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  51.39 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  52.6 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  52.18 
 
 		 484 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  52.71 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  51.58 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  50.54 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  44.61 
 
 		 482 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  44.4 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  46.79 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  52.53 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  47.81 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  44.91 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  41.91 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  43.21 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.74 
 
 		 498 aa  352  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  44.86 
 
 		 498 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  41.42 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.9 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  38.51 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.59 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  39.6 
 
 		 484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  38.63 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  38.1 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  42.86 
 
 		 510 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.84 
 
 		 481 aa  310  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.29 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  38.88 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  36.38 
 
 		 491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.02 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.02 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.6 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  37.24 
 
 		 483 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  39.3 
 
 		 484 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.45 
 
 		 483 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  38.89 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  38.89 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.91 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.23 
 
 		 478 aa  295  9e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  37.19 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.83 
 
 		 485 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  39 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  36.95 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  38.57 
 
 		 488 aa  292  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  38.57 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  39.43 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.91 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  39.23 
 
 		 478 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  36.69 
 
 		 494 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.99 
 
 		 483 aa  279  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  37.63 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.48 
 
 		 483 aa  279  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  32.85 
 
 		 479 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  35.52 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  35.73 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  35.88 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.45 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.51 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  36.4 
 
 		 485 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  36.72 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  35.21 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.9 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.77 
 
 		 483 aa  269  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.63 
 
 		 485 aa  269  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.48 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  34.43 
 
 		 485 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  35.46 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.43 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.45 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  37.53 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  34.43 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>