255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1826 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 		 484 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  69.21 
 
 		 484 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  68.53 
 
 		 484 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  67.56 
 
 		 484 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 483 aa  968    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  68.39 
 
 		 484 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  74.53 
 
 		 483 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  68.39 
 
 		 484 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  69.57 
 
 		 484 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  69.21 
 
 		 484 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  69.21 
 
 		 484 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  68.32 
 
 		 484 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  67.98 
 
 		 484 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  69.36 
 
 		 484 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  69.21 
 
 		 484 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  67.77 
 
 		 484 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  54.28 
 
 		 480 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  53.73 
 
 		 481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  54.91 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  54.07 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  53.56 
 
 		 480 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  52.92 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  54.91 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  53.86 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.67 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  53.44 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  53.75 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.65 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  54.81 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  48.42 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  50.94 
 
 		 490 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  49.89 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  49.38 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  53.07 
 
 		 493 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.96 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  48.47 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  43.75 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  40.29 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.12 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  41.94 
 
 		 466 aa  359  5e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  42.44 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  41.63 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  41.25 
 
 		 498 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  38.59 
 
 		 466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  37.71 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.25 
 
 		 484 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  35.97 
 
 		 482 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  35.97 
 
 		 482 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.17 
 
 		 482 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  34.39 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  40.25 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.61 
 
 		 488 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.37 
 
 		 479 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.09 
 
 		 483 aa  289  9e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.03 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.42 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.52 
 
 		 498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.98 
 
 		 483 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.38 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.4 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  39.49 
 
 		 494 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.46 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  34.95 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.88 
 
 		 484 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  39.69 
 
 		 484 aa  280  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  37.11 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  36.04 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  36.31 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.8 
 
 		 483 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.96 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.52 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  33.61 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.7 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.63 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  35.14 
 
 		 484 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.42 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.63 
 
 		 483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  35.14 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.48 
 
 		 485 aa  270  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.12 
 
 		 485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.44 
 
 		 485 aa  269  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  36.17 
 
 		 482 aa  269  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.46 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.16 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  32.68 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  32.93 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  33.12 
 
 		 486 aa  266  5e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  37.35 
 
 		 488 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  38.65 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  35.9 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  37.14 
 
 		 488 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  37.34 
 
 		 486 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.46 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  36.42 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.66 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>