220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0536 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  100 
 
 		 482 aa  966    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  61.44 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  61.44 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  61.57 
 
 		 484 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  48.86 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  50.21 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  49.69 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  48.86 
 
 		 482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  48.86 
 
 		 482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  37.55 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  38.51 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  37.6 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  36.72 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  37.76 
 
 		 480 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  40.54 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  38.17 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  37.76 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  38.59 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  36.59 
 
 		 480 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  36.59 
 
 		 480 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.59 
 
 		 480 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  38.29 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  36.59 
 
 		 480 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 		 480 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.57 
 
 		 480 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  36.51 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  39.17 
 
 		 483 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  37.34 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  36.51 
 
 		 480 aa  297  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  39.75 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  37.37 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 		 480 aa  295  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.61 
 
 		 484 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  36.72 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  36.79 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  37.84 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  37.2 
 
 		 484 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  38.12 
 
 		 483 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  38.25 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  40.79 
 
 		 493 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  37.2 
 
 		 484 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  36.38 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  37.63 
 
 		 484 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  36.38 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  35.07 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  38.59 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  36.73 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  35.95 
 
 		 480 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  36.04 
 
 		 484 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  33.82 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  33.69 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  33.61 
 
 		 484 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  36.02 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  34.86 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  36.02 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  34.84 
 
 		 485 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  33.33 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.16 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  34.48 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  35.73 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  34.31 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  32.85 
 
 		 482 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  32.72 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  34.7 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  34.1 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.15 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  33.4 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.1 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  32.38 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  32.53 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  35.88 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  31.76 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  34.63 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  37.04 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  31.17 
 
 		 488 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  31.17 
 
 		 488 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  33.19 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  33 
 
 		 481 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  33.57 
 
 		 484 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  34.22 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  34.22 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  33.26 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  31.91 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  33.19 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  33.47 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  35 
 
 		 483 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  33.19 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  31.78 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  31.91 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  30.64 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  33.95 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.99 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  30.1 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  35.74 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  33.74 
 
 		 483 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  30.86 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  31.97 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  31.57 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  29.47 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  32.2 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>