238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1567 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  91.12 
 
 		 484 aa  859    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  68.74 
 
 		 484 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  68.74 
 
 		 484 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  69.77 
 
 		 484 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  70.19 
 
 		 484 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  69.98 
 
 		 484 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  68.94 
 
 		 484 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  74.79 
 
 		 484 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 484 aa  948    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  90.5 
 
 		 484 aa  843    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  68.94 
 
 		 484 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  69.15 
 
 		 484 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  68.94 
 
 		 484 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  74.17 
 
 		 484 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  68.74 
 
 		 483 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  68.53 
 
 		 483 aa  621  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  53.03 
 
 		 481 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  53.86 
 
 		 480 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  52.19 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  52.19 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  52.61 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  53.75 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  54.07 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  52.3 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  52.19 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  53.24 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  52.3 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  53.24 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  52.3 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  52.3 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  52.82 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  52.4 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  53.35 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  56.32 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  49.37 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  49.06 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.59 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  49.37 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  42.12 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.21 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  46.09 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  47.77 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  41.49 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.83 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.9 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.33 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.41 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.24 
 
 		 466 aa  324  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  40.29 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  40.53 
 
 		 510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.37 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  37.37 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  38.05 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.03 
 
 		 482 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.23 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.3 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  37.5 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.04 
 
 		 484 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  38.7 
 
 		 494 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  36.29 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  37.06 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  35.52 
 
 		 481 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.11 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.04 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.56 
 
 		 483 aa  279  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.83 
 
 		 485 aa  279  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.18 
 
 		 478 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  39.31 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.32 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  39.79 
 
 		 484 aa  276  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  34.81 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  33.4 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.55 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  38.04 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.35 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  35.07 
 
 		 483 aa  269  8.999999999999999e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.76 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.59 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  38.08 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  34.92 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  34.86 
 
 		 483 aa  263  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.99 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  32.73 
 
 		 485 aa  263  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  36.46 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.66 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.96 
 
 		 479 aa  261  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  34.03 
 
 		 486 aa  260  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  34.16 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  37.24 
 
 		 481 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  34.65 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.91 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.17 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.26 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  35.97 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  37.38 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.42 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  35.82 
 
 		 482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  36.21 
 
 		 486 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>