227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 
484 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  72.93 
 
 
484 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  71.69 
 
 
484 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  71.9 
 
 
484 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  73.14 
 
 
484 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  73.55 
 
 
484 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  100 
 
 
483 aa  964    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  68.74 
 
 
484 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  68.53 
 
 
484 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  72.73 
 
 
484 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  71.07 
 
 
484 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  69.98 
 
 
484 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  73.76 
 
 
484 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  71.07 
 
 
484 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  69.98 
 
 
484 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  74.53 
 
 
483 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  54.58 
 
 
480 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  52.71 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  53.96 
 
 
480 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  54.28 
 
 
480 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  53.96 
 
 
480 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  53.96 
 
 
480 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  53.96 
 
 
480 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  55 
 
 
480 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  53.33 
 
 
481 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  53.75 
 
 
480 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  53.54 
 
 
481 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  53.24 
 
 
480 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  53.54 
 
 
480 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.54 
 
 
480 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  53.75 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.44 
 
 
480 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  53.25 
 
 
480 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  50.52 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  54.87 
 
 
493 aa  438  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  49.69 
 
 
481 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.47 
 
 
472 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.34 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.8 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  43.54 
 
 
485 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  46.72 
 
 
498 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  40.79 
 
 
482 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.33 
 
 
482 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.48 
 
 
498 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.35 
 
 
466 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  43.56 
 
 
466 aa  339  8e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.71 
 
 
466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.71 
 
 
500 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  39.5 
 
 
482 aa  329  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  42.5 
 
 
484 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.42 
 
 
482 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  37.42 
 
 
482 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  40.79 
 
 
510 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  39.5 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  41.06 
 
 
488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.85 
 
 
483 aa  299  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  36.48 
 
 
479 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.22 
 
 
482 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.42 
 
 
481 aa  295  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.43 
 
 
483 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.33 
 
 
478 aa  293  4e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  38.16 
 
 
498 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  38.88 
 
 
484 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  37.5 
 
 
483 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  38.67 
 
 
484 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  38.96 
 
 
484 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.1 
 
 
485 aa  289  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.22 
 
 
488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.28 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  34.97 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.89 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  37.37 
 
 
483 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.41 
 
 
466 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.14 
 
 
485 aa  279  9e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  39.3 
 
 
485 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.73 
 
 
485 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  37.78 
 
 
485 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  38.78 
 
 
488 aa  277  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  39.53 
 
 
491 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  41.09 
 
 
484 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  35.63 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  37.73 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.86 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.11 
 
 
484 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.76 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.98 
 
 
483 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.58 
 
 
485 aa  272  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.45 
 
 
485 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.99 
 
 
485 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  37.35 
 
 
478 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.74 
 
 
484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.17 
 
 
485 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  35.23 
 
 
486 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  38.19 
 
 
482 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.53 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  35.91 
 
 
481 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.29 
 
 
483 aa  266  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.17 
 
 
483 aa  264  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  36.55 
 
 
485 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>