249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0024 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  69.07 
 
 		 483 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  93.81 
 
 		 485 aa  904    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  82.92 
 
 		 486 aa  791    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  66.19 
 
 		 483 aa  684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  68.66 
 
 		 485 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  84.12 
 
 		 485 aa  813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  69.69 
 
 		 485 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  81.03 
 
 		 485 aa  799    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 		 485 aa  813    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  84.54 
 
 		 485 aa  816    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  84.74 
 
 		 485 aa  817    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 485 aa  977    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  84.54 
 
 		 485 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  83.3 
 
 		 485 aa  819    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  69.07 
 
 		 485 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  84.54 
 
 		 485 aa  816    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  68.66 
 
 		 485 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  85.57 
 
 		 485 aa  845    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  89.07 
 
 		 485 aa  846    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 		 485 aa  813    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 		 485 aa  813    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  92.16 
 
 		 485 aa  892    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  63.06 
 
 		 488 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  62.89 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  64.33 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  64.95 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  64.95 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  64.54 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  64.12 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  64.95 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  64.95 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  64.95 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  63.92 
 
 		 483 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  66.39 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  63.71 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  63.71 
 
 		 483 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  63.71 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  64.54 
 
 		 483 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  64.54 
 
 		 483 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  58.52 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  64.33 
 
 		 483 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  57.11 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  57.53 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  56.49 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  54.34 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  54.23 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  54.85 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  51.96 
 
 		 481 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  54.6 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  48.98 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  48.41 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  47.89 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  46.07 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  41.94 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  43.62 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  44.86 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  45.88 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  42.15 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  42.56 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  44.24 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  43.09 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  44.17 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  43.67 
 
 		 484 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  42.39 
 
 		 488 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  42.18 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  43.4 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  40.78 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  43.85 
 
 		 481 aa  358  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.19 
 
 		 482 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.16 
 
 		 479 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  40.17 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  42.33 
 
 		 482 aa  340  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.86 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  41.19 
 
 		 483 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.82 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  36.96 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  39.76 
 
 		 491 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.71 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.53 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  39.96 
 
 		 477 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.86 
 
 		 480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  39.83 
 
 		 483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  35.66 
 
 		 481 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  38.03 
 
 		 484 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.63 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  34.62 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.41 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36.61 
 
 		 483 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.47 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  35.45 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  37.26 
 
 		 484 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.31 
 
 		 485 aa  293  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  34.08 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>