274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4507 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 
484 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
484 aa  966    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  95.45 
 
 
484 aa  905    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  72.93 
 
 
483 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  84.5 
 
 
484 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  80.37 
 
 
484 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  85.12 
 
 
484 aa  818    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  90.08 
 
 
484 aa  871    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  99.17 
 
 
484 aa  960    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  98.76 
 
 
484 aa  956    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  69.36 
 
 
484 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  68.94 
 
 
484 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  80.79 
 
 
484 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  69.98 
 
 
484 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  68.74 
 
 
484 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  69.21 
 
 
483 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  51.04 
 
 
481 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  52.07 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.66 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  51.56 
 
 
480 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  51.04 
 
 
480 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  50.62 
 
 
480 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  50.83 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 
480 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  49.79 
 
 
480 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 
480 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  50.83 
 
 
480 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 
480 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  49.38 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  49.38 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  49.9 
 
 
480 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  49.17 
 
 
480 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  49.38 
 
 
480 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  50.42 
 
 
480 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.45 
 
 
481 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  48.34 
 
 
481 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.24 
 
 
472 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  46.97 
 
 
490 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  51.11 
 
 
493 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  47.94 
 
 
498 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  39.17 
 
 
482 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  40.49 
 
 
482 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  42.74 
 
 
485 aa  362  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  37.97 
 
 
482 aa  359  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.33 
 
 
498 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.35 
 
 
466 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.37 
 
 
466 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  38.97 
 
 
466 aa  330  3e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  38.41 
 
 
500 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.57 
 
 
484 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.05 
 
 
481 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.98 
 
 
482 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.74 
 
 
478 aa  301  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.32 
 
 
488 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 
483 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.24 
 
 
488 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  33.82 
 
 
482 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  33.82 
 
 
482 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.22 
 
 
491 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.7 
 
 
483 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.33 
 
 
485 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.6 
 
 
482 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  36.12 
 
 
498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  38.32 
 
 
485 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.38 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  37.27 
 
 
484 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  37.55 
 
 
488 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.59 
 
 
483 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.37 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.07 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.78 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  38.18 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  37.08 
 
 
510 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  40.99 
 
 
484 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  35.41 
 
 
484 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.65 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.73 
 
 
485 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  36.08 
 
 
483 aa  280  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.42 
 
 
494 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  36.8 
 
 
484 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.07 
 
 
484 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.99 
 
 
481 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  37 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  33.97 
 
 
479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.02 
 
 
483 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.55 
 
 
486 aa  274  3e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.48 
 
 
485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.17 
 
 
485 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.11 
 
 
466 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  35.91 
 
 
483 aa  271  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.12 
 
 
481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.32 
 
 
485 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.65 
 
 
482 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 
482 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.12 
 
 
483 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 
485 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.65 
 
 
485 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.32 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  31.88 
 
 
485 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>