218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2406 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  65.56 
 
 		 482 aa  648    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  67.22 
 
 		 482 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  100 
 
 		 482 aa  950    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  54.13 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  53.93 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  50.21 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  55.07 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  47.82 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  47.82 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  44.61 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.64 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  41.29 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  41.7 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  42.36 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  45.02 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  40.33 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  42.2 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  42.12 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  42.58 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  40.7 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  40.34 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.83 
 
 		 498 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  39.27 
 
 		 484 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  44.38 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  41.82 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  41.61 
 
 		 480 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  39.06 
 
 		 484 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  41.7 
 
 		 484 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  40.5 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  41.2 
 
 		 480 aa  358  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  41.74 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  41.74 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  41.74 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  41.74 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  41.41 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  42.64 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  39.27 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  40.75 
 
 		 480 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  38.2 
 
 		 484 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  38.2 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  41.46 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  39.48 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  39.67 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  41.25 
 
 		 484 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  42.04 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  39.75 
 
 		 484 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  40.46 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  39.75 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  40.54 
 
 		 483 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  40.43 
 
 		 483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  44.93 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  40.79 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.88 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  42.48 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  38.49 
 
 		 481 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  39.46 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  38.41 
 
 		 484 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  38.25 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  38.53 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.97 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.55 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.4 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.33 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.51 
 
 		 484 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.79 
 
 		 484 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  35.71 
 
 		 481 aa  280  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  38 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.61 
 
 		 479 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  37.01 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.22 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.96 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  37.8 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.17 
 
 		 485 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.8 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  38.19 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.76 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.07 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.25 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.59 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.69 
 
 		 485 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  37.03 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  39.92 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.44 
 
 		 491 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  35.49 
 
 		 483 aa  261  1e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.4 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.55 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.38 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  36.55 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  36.55 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.55 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.46 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  34.37 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.06 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  34.93 
 
 		 485 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 		 485 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  36.34 
 
 		 485 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.23 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.27 
 
 		 486 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  33.06 
 
 		 485 aa  256  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>