235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2219 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 
487 aa  981    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.98 
 
 
494 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  39.66 
 
 
481 aa  343  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  38.21 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.85 
 
 
466 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  37.19 
 
 
479 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.52 
 
 
479 aa  329  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.6 
 
 
498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  38.67 
 
 
481 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  39.4 
 
 
482 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  40.41 
 
 
482 aa  317  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  39.65 
 
 
491 aa  316  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  38.3 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.91 
 
 
478 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36.49 
 
 
483 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  36.96 
 
 
482 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  37.68 
 
 
485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  37.47 
 
 
482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  37.04 
 
 
485 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.2 
 
 
481 aa  289  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  37.21 
 
 
479 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  34.74 
 
 
477 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  36.29 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.93 
 
 
488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  39.19 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  36.68 
 
 
481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.57 
 
 
481 aa  279  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  35.74 
 
 
510 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.38 
 
 
485 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  34.29 
 
 
483 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.71 
 
 
483 aa  275  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  36.55 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.27 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  38.63 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.64 
 
 
483 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  37.99 
 
 
486 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.04 
 
 
498 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  36.07 
 
 
485 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  34.9 
 
 
481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  34.93 
 
 
484 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 
485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 
485 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 
485 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  37.27 
 
 
485 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.73 
 
 
480 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  38.19 
 
 
482 aa  269  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  34.93 
 
 
484 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  34.63 
 
 
485 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  37.5 
 
 
472 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  35.45 
 
 
485 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.52 
 
 
485 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  35.5 
 
 
485 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.29 
 
 
485 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 
485 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 
485 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.12 
 
 
483 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 
485 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  35.42 
 
 
485 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  36.23 
 
 
490 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  33.95 
 
 
482 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  34.34 
 
 
487 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  35.21 
 
 
486 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.65 
 
 
491 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  35.73 
 
 
485 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.73 
 
 
485 aa  260  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  36.89 
 
 
481 aa  260  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  38.48 
 
 
481 aa  259  6e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  33.84 
 
 
484 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  33.62 
 
 
484 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  34.06 
 
 
484 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  33.84 
 
 
484 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  33.47 
 
 
488 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  36.74 
 
 
483 aa  257  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  33.91 
 
 
483 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  36.81 
 
 
481 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.36 
 
 
488 aa  256  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  33.95 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  33.94 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.64 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  36.73 
 
 
483 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  36.73 
 
 
483 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  36.73 
 
 
483 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  36.73 
 
 
483 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.32 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  36.73 
 
 
483 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  36.33 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  32.11 
 
 
514 aa  253  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  34.65 
 
 
483 aa  253  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  36.33 
 
 
483 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.08 
 
 
483 aa  252  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  36.33 
 
 
483 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.32 
 
 
484 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  33.41 
 
 
484 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  35.58 
 
 
483 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>