267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0028 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  95.63 
 
 		 481 aa  889    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  100 
 
 		 481 aa  941    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  96.26 
 
 		 481 aa  891    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  43.04 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  40.75 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  39.83 
 
 		 481 aa  359  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  42.95 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  43.15 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  42.32 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.78 
 
 		 479 aa  342  7e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  38.72 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  39.71 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  40.33 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.63 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  42.03 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  39.38 
 
 		 482 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  41.44 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  38.38 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  40.21 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.37 
 
 		 477 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  38.19 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  39 
 
 		 481 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  38.92 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  36.47 
 
 		 524 aa  317  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  41.96 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  40.39 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.62 
 
 		 480 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  40 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  34.1 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  40.04 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  39.15 
 
 		 505 aa  302  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.76 
 
 		 485 aa  299  7e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.81 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  38.2 
 
 		 488 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  37.48 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.89 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.22 
 
 		 483 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.38 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.29 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  38.51 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  38.24 
 
 		 485 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  37.11 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.71 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.61 
 
 		 478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  35.56 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  38.73 
 
 		 512 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.55 
 
 		 488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  36.8 
 
 		 485 aa  280  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  38.34 
 
 		 512 aa  279  6e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.1 
 
 		 485 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  37.12 
 
 		 520 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.61 
 
 		 498 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  39.67 
 
 		 484 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  35.33 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.81 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  37.63 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  37.42 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  34.63 
 
 		 487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  37.7 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  37.7 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  37.7 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  37.7 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  37.7 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.61 
 
 		 485 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  32.64 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  34.91 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  37.91 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  37.91 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.08 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  37.69 
 
 		 486 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.18 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  37.22 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  33.88 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  34.76 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  37.3 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.63 
 
 		 485 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  35.99 
 
 		 485 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  35.93 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  37.66 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  37.22 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  40.48 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  35.14 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.45 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.45 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.04 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.52 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  39.2 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  36.89 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  36.13 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  36.48 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>