243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2082 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  66.67 
 
 
520 aa  667    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  100 
 
 
514 aa  1016    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  63.3 
 
 
512 aa  621  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  57.67 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  55.56 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  58.09 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  55.04 
 
 
516 aa  529  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  48.15 
 
 
502 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  46.44 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  42.07 
 
 
479 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  39.29 
 
 
478 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  42.38 
 
 
514 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  40.82 
 
 
483 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  41.36 
 
 
476 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  37.98 
 
 
524 aa  340  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  38.95 
 
 
481 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  39.72 
 
 
479 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  41.11 
 
 
494 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.28 
 
 
477 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.51 
 
 
466 aa  319  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  41.14 
 
 
481 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  38.6 
 
 
482 aa  316  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  38.19 
 
 
481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  38.36 
 
 
482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.72 
 
 
483 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  37.4 
 
 
481 aa  296  6e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  38.81 
 
 
473 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.55 
 
 
480 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  36.81 
 
 
481 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  35.52 
 
 
485 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  41.41 
 
 
494 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  39.36 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  38.07 
 
 
495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.72 
 
 
498 aa  283  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.17 
 
 
482 aa  279  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  32.69 
 
 
487 aa  279  8e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  36.83 
 
 
483 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.29 
 
 
491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  36.89 
 
 
478 aa  273  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  34.07 
 
 
482 aa  270  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  35.38 
 
 
486 aa  270  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  31.91 
 
 
485 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.17 
 
 
483 aa  263  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  38.05 
 
 
485 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.97 
 
 
483 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.95 
 
 
485 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.16 
 
 
483 aa  260  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.69 
 
 
488 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.48 
 
 
485 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.54 
 
 
485 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  32.22 
 
 
480 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.76 
 
 
498 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.22 
 
 
483 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  35.56 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  34.65 
 
 
482 aa  253  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.92 
 
 
491 aa  253  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36 
 
 
483 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  33.21 
 
 
481 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  32.68 
 
 
485 aa  249  7e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  34.11 
 
 
485 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.17 
 
 
485 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  37.65 
 
 
484 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  36.02 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.22 
 
 
488 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  36.3 
 
 
478 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  31.91 
 
 
480 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  31.72 
 
 
481 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  33.53 
 
 
485 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  33.91 
 
 
485 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  31.26 
 
 
481 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  32.95 
 
 
485 aa  239  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  34.66 
 
 
485 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  35.84 
 
 
488 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  34.46 
 
 
485 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.69 
 
 
485 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  34.46 
 
 
485 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  33.2 
 
 
485 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  34.47 
 
 
486 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  33.94 
 
 
483 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  31.71 
 
 
480 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  32.15 
 
 
485 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  34.55 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  31.25 
 
 
480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  32.98 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  34.2 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  33.27 
 
 
488 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  32.56 
 
 
485 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  34.39 
 
 
485 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  34.95 
 
 
483 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  31.05 
 
 
480 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  34.75 
 
 
483 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  31.18 
 
 
480 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  34.75 
 
 
483 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  30.27 
 
 
480 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.27 
 
 
480 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  32.19 
 
 
486 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  30.27 
 
 
480 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>