268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0265 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  100 
 
 		 466 aa  925    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  56.16 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  48.94 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  46.65 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  42.95 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  47.8 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  42.42 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  43.26 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  39.7 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  43.84 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  48.03 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  44.81 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  41.29 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  40.3 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  40.99 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  40.69 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  40.88 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  43.85 
 
 		 491 aa  356  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  41.68 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  39.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  43.85 
 
 		 481 aa  350  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  43.4 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  37.26 
 
 		 524 aa  346  5e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.68 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  42.95 
 
 		 481 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  40.6 
 
 		 498 aa  338  9e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  38.85 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  41.65 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  41.47 
 
 		 481 aa  332  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  40.9 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  42.69 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  38.94 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  39.82 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  39.49 
 
 		 485 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  41.48 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  39.95 
 
 		 485 aa  319  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  37.69 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  37.76 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  42.49 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  38.26 
 
 		 485 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  41.73 
 
 		 478 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.85 
 
 		 485 aa  310  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  38.39 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  38.44 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  41.8 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.31 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  38.28 
 
 		 485 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.05 
 
 		 483 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  37.34 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  38.15 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  38.15 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  38.06 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  38.06 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  38.15 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  38.15 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  38.93 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  38.06 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  39.2 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  40.09 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.74 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.91 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  38.98 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  38.51 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  35.84 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  39.57 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  38.5 
 
 		 488 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  37.03 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.5 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  37.59 
 
 		 487 aa  293  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  34.65 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  39.76 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  37.15 
 
 		 485 aa  289  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  37.95 
 
 		 505 aa  289  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  38.13 
 
 		 486 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  39.63 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  40.72 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  40.72 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  40.72 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  37.95 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  40.72 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  40.72 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  37.65 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  41.34 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  33.85 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  41.15 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  41.36 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  37.2 
 
 		 472 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  33.77 
 
 		 484 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  39.82 
 
 		 483 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  40.96 
 
 		 485 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  33.77 
 
 		 484 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  39.29 
 
 		 488 aa  282  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>