236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0635 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  100 
 
 		 479 aa  947    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  40.63 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  38.17 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  38.19 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.41 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  37.8 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  40.12 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.17 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  37.47 
 
 		 482 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  40.56 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.66 
 
 		 498 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  36.17 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  38.22 
 
 		 482 aa  272  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.3 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  35.05 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  36.48 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.3 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  35.73 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.22 
 
 		 491 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  33.69 
 
 		 479 aa  266  8e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  36.29 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  34.09 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  34.95 
 
 		 483 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  36.77 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  32.47 
 
 		 485 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  32.9 
 
 		 478 aa  259  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  35.08 
 
 		 482 aa  259  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  34.41 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  33.47 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  32.92 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  31.34 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.24 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.62 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  34.87 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.57 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  32.92 
 
 		 491 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  37.12 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.01 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.05 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  34.52 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  33.12 
 
 		 481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  33.13 
 
 		 483 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  33.33 
 
 		 481 aa  242  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  33.65 
 
 		 484 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  33.26 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  32.9 
 
 		 481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  36.85 
 
 		 481 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  33.54 
 
 		 486 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  33.82 
 
 		 485 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  31.42 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  33.26 
 
 		 483 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  35.08 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  32.85 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  36.62 
 
 		 481 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  33.61 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  33.61 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  33.96 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  33.96 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  33.96 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  33.96 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  33.33 
 
 		 488 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  32.99 
 
 		 485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  30.77 
 
 		 486 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  34.55 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.4 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  36.38 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  34.15 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  34.33 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  32.11 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  34.55 
 
 		 505 aa  234  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  32.86 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  32.8 
 
 		 484 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  32.08 
 
 		 512 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  33.88 
 
 		 485 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  32.54 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  33.91 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  34.12 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  34.01 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  32.46 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  32.74 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  31.34 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  34.97 
 
 		 480 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  33.76 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  34.43 
 
 		 480 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  33.41 
 
 		 480 aa  229  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.8 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  33.69 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  33.69 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  33.69 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  33.69 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  31.88 
 
 		 484 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  32.11 
 
 		 484 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  33.76 
 
 		 490 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  32.66 
 
 		 482 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  33.12 
 
 		 480 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  33 
 
 		 485 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  31.9 
 
 		 483 aa  226  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  31.65 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  32.91 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>