217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0640 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  88.61 
 
 		 484 aa  802    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  88.41 
 
 		 484 aa  802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  100 
 
 		 484 aa  958    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  61.57 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  55.07 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  53.62 
 
 		 482 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  53.67 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  51.35 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  51.35 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  38.97 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  39.71 
 
 		 481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  40.83 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  38.35 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  39.26 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  38.84 
 
 		 480 aa  326  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  38.22 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  37.89 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  37.68 
 
 		 480 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  37.4 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  40.75 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  37.73 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  36.78 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  37.32 
 
 		 480 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  39.87 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  39.22 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  41.25 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  40.13 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  37.31 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  38.96 
 
 		 483 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.4 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.1 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  36.57 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  36.03 
 
 		 484 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  36.03 
 
 		 484 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  36.36 
 
 		 484 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  37.31 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  36.11 
 
 		 483 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  37.94 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  35.59 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  36.08 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  36.8 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  36.27 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  35 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  40.84 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.91 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  35.87 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  35.97 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.63 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  35.55 
 
 		 484 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  33.97 
 
 		 466 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  34.65 
 
 		 484 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  34.57 
 
 		 484 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  36.85 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  35.2 
 
 		 510 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.34 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.68 
 
 		 482 aa  253  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.13 
 
 		 488 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  33.12 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  37.1 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  33.2 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  34.23 
 
 		 482 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  33.33 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.65 
 
 		 485 aa  246  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.14 
 
 		 483 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  32.79 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.54 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.76 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.9 
 
 		 481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  35.06 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  35.66 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  34.05 
 
 		 488 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  35.45 
 
 		 483 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.22 
 
 		 485 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.11 
 
 		 485 aa  236  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  34.01 
 
 		 485 aa  236  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  33.61 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  33.68 
 
 		 485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  32.53 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.64 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  34.87 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.94 
 
 		 480 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  35.21 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  33.75 
 
 		 494 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.9 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  34.14 
 
 		 485 aa  230  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  38.44 
 
 		 484 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  34.64 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  35.21 
 
 		 488 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 		 485 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 		 485 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  35.38 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  33.06 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.19 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  31.16 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>