251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1654 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  92.73 
 
 
495 aa  926    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
499 aa  994    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  53.17 
 
 
493 aa  500  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  44.47 
 
 
498 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  41.99 
 
 
514 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  42.11 
 
 
497 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  30.93 
 
 
482 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  31.57 
 
 
479 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  30.42 
 
 
481 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  31.24 
 
 
467 aa  197  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  30.72 
 
 
481 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.79 
 
 
479 aa  189  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  33.1 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  28.81 
 
 
483 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  31.47 
 
 
480 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  32.16 
 
 
481 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  31.05 
 
 
481 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  31.81 
 
 
491 aa  180  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.47 
 
 
516 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  30.99 
 
 
482 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  30.27 
 
 
482 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  33.48 
 
 
481 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  31.01 
 
 
484 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  30.11 
 
 
485 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  31.67 
 
 
481 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  30.61 
 
 
483 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  30.22 
 
 
506 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  30.45 
 
 
483 aa  177  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  32.15 
 
 
486 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  29.73 
 
 
482 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  29.73 
 
 
484 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  29.54 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.03 
 
 
485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  29.46 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  30.35 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  27.53 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  29.5 
 
 
484 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  29.48 
 
 
498 aa  174  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.3 
 
 
484 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  29.05 
 
 
484 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  29.19 
 
 
486 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  29.38 
 
 
483 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  28.39 
 
 
480 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  29.4 
 
 
480 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  28.33 
 
 
484 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  26.05 
 
 
524 aa  170  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  30 
 
 
485 aa  170  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  28.39 
 
 
480 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  28.57 
 
 
480 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  28.48 
 
 
466 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  28.54 
 
 
483 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  28.99 
 
 
482 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.15 
 
 
476 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  29.23 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  31.11 
 
 
503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  31.03 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  29.17 
 
 
480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  28.75 
 
 
488 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  28.74 
 
 
485 aa  163  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  28.81 
 
 
485 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  30.46 
 
 
484 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  27.22 
 
 
483 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.46 
 
 
480 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  27.18 
 
 
478 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.13 
 
 
483 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  30.77 
 
 
478 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.83 
 
 
513 aa  160  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  27.69 
 
 
480 aa  160  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  29.38 
 
 
485 aa  160  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  29.15 
 
 
508 aa  160  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  29.28 
 
 
485 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  29.63 
 
 
485 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  29.02 
 
 
485 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  28.95 
 
 
485 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.91 
 
 
508 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  29.67 
 
 
485 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  28.6 
 
 
474 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  28.54 
 
 
485 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  29.04 
 
 
485 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.16 
 
 
485 aa  156  8e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  30.12 
 
 
512 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.34 
 
 
483 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  28.72 
 
 
484 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  34.63 
 
 
511 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  29.44 
 
 
486 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  29.59 
 
 
485 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  28.96 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  30.12 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.48 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  30.45 
 
 
485 aa  153  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  29.67 
 
 
483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  29.46 
 
 
490 aa  153  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  28.57 
 
 
472 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.71 
 
 
483 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  29.01 
 
 
480 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  28.45 
 
 
485 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  28.45 
 
 
485 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  30.68 
 
 
484 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  28.45 
 
 
485 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  29.46 
 
 
488 aa  150  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>