295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1921 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  100 
 
 
514 aa  1009    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  43.14 
 
 
495 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  42.02 
 
 
499 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  43.33 
 
 
493 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  39.61 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  39.15 
 
 
497 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.86 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  29.69 
 
 
503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  35.57 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  30.23 
 
 
482 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  30.63 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  29.15 
 
 
481 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  32.16 
 
 
481 aa  181  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  30.86 
 
 
494 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  32.36 
 
 
481 aa  179  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  30.79 
 
 
479 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  28.69 
 
 
482 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.24 
 
 
480 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  29.85 
 
 
481 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  32.84 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.25 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  27.9 
 
 
485 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  26.22 
 
 
481 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  28.46 
 
 
485 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  27.24 
 
 
487 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  29.91 
 
 
481 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.02 
 
 
484 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  27.02 
 
 
484 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  29.56 
 
 
478 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.93 
 
 
516 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  26.26 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  28.45 
 
 
485 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  26.46 
 
 
484 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  27.88 
 
 
483 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  27.43 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  26.87 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  26.34 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  26.34 
 
 
484 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  32.05 
 
 
486 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  30.48 
 
 
485 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  28.94 
 
 
481 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  25.96 
 
 
486 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  29.85 
 
 
481 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  26.81 
 
 
485 aa  160  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  30.96 
 
 
478 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  28.04 
 
 
482 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  30.6 
 
 
513 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  27.35 
 
 
486 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  25.32 
 
 
485 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  29.37 
 
 
478 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  30.55 
 
 
480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  28.29 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  27.54 
 
 
506 aa  153  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  27.67 
 
 
487 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  30 
 
 
485 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  28.35 
 
 
482 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  29.98 
 
 
511 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  29.96 
 
 
480 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  26.11 
 
 
508 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  27.89 
 
 
483 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  29.74 
 
 
480 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  27.06 
 
 
483 aa  150  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  28.63 
 
 
483 aa  150  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  27.66 
 
 
477 aa  150  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  25.36 
 
 
524 aa  149  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  26.61 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.73 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  29.52 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  28.29 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  25.78 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  31.27 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  27.25 
 
 
476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  27.18 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  29.83 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  27.57 
 
 
485 aa  148  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  26.03 
 
 
483 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  26.78 
 
 
491 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  28.39 
 
 
481 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  29.01 
 
 
485 aa  146  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  25.94 
 
 
483 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  26.39 
 
 
482 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  28.57 
 
 
480 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  28.44 
 
 
466 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  27.73 
 
 
485 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  28.44 
 
 
466 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  28.28 
 
 
484 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  28.14 
 
 
498 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  27.5 
 
 
485 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  27.65 
 
 
484 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  28.26 
 
 
503 aa  143  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.66 
 
 
508 aa  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  27.54 
 
 
485 aa  143  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  28.07 
 
 
485 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  28.07 
 
 
485 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  28.07 
 
 
485 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  28.07 
 
 
485 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  27.97 
 
 
480 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  26.38 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  27.6 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  28.07 
 
 
485 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>