296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1367 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  100 
 
 		 508 aa  1018    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  47.93 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  44.1 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  45.95 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  35.98 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  30.71 
 
 		 513 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  29.08 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  31.22 
 
 		 481 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  30.47 
 
 		 467 aa  194  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  30.6 
 
 		 484 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  30.47 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  29.65 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  29.65 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  29.14 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  26.85 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  30.59 
 
 		 484 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  30.16 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  29.65 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  29.87 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  31.57 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.81 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  26.68 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  30 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  28.81 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  28.54 
 
 		 480 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  26.14 
 
 		 479 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  28.54 
 
 		 480 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  27.87 
 
 		 479 aa  174  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  30.43 
 
 		 484 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  29.15 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  28.92 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  30.57 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  28.34 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  32.43 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  30.88 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  27.33 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  27.72 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  26.5 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  28.42 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  27.48 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  29.95 
 
 		 479 aa  163  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  29.96 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  28.07 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  28.07 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  29.34 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.98 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  28.26 
 
 		 484 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  26.11 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.46 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  28.99 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  31.65 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  27.84 
 
 		 484 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  29.18 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  28.64 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  25.47 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  30.07 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  28.47 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  27.58 
 
 		 498 aa  156  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  29.51 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  26.51 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  28.74 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  27.96 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  29.27 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  29.14 
 
 		 483 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  28.27 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  30.45 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  27.48 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  28.08 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  27.04 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.24 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  26.76 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  23.63 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  26.08 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  25.43 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  28.64 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  29.23 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  28.1 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  26.19 
 
 		 503 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  27.8 
 
 		 477 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  27.03 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  25.64 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  28.61 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  27.17 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.36 
 
 		 508 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  28.67 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  27.8 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  26.06 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  29.06 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  28.13 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  27.99 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  26.42 
 
 		 502 aa  144  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  26.46 
 
 		 482 aa  143  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  27.84 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  27.84 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  29.64 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  25.64 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  30.38 
 
 		 514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  28.22 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  30.16 
 
 		 478 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  30.14 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>