253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1243 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  100 
 
 		 480 aa  954    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  97.08 
 
 		 480 aa  908    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  96.25 
 
 		 480 aa  903    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  79.79 
 
 		 480 aa  768    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  36.71 
 
 		 467 aa  249  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  33.48 
 
 		 516 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  32.87 
 
 		 485 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  31.52 
 
 		 513 aa  203  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  32.43 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  32.02 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  28.54 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  30.9 
 
 		 483 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  28.39 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  28.95 
 
 		 495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  28.34 
 
 		 508 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  28.9 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  30.61 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  32.42 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  29.34 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  31.54 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  29.34 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  27.94 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  29.51 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.49 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  28.24 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  29.55 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.57 
 
 		 485 aa  166  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.61 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  28.78 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  28 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.18 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  27.94 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.27 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  29.69 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  27.37 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  29.34 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  27.46 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.91 
 
 		 480 aa  159  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  29.52 
 
 		 514 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  30.24 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  28.57 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  27.94 
 
 		 478 aa  156  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  29.89 
 
 		 477 aa  156  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  30.27 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  30.16 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  28.63 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  27.1 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.25 
 
 		 484 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.14 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  28.43 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  26.8 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  31.42 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  31.35 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  29.26 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  31.68 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  27.35 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  28.69 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  30.28 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  28.97 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  28.28 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  30.28 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.28 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  30.28 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  27.03 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  28.33 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.71 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  29.05 
 
 		 479 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.39 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  27.03 
 
 		 484 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  27.4 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  29.39 
 
 		 480 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  29.18 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  28.98 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  28.48 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  25.64 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  26.8 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  29.11 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00720  Trk-type K+ transport system, membrane component  29.11 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  29.14 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  25.31 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  29.64 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.48 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  29.66 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  27.53 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  26.81 
 
 		 482 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  28.3 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  25.47 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  29.18 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  24.74 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  27.85 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  26.55 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  26.9 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  24.9 
 
 		 510 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  27.87 
 
 		 494 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  25.26 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  27.65 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  27.13 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  28.45 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  27.8 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  27.9 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>