298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1217 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  100 
 
 		 513 aa  1009    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  73.89 
 
 		 516 aa  755    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  41.37 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  41.54 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  34.96 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.12 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  31.09 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  31.31 
 
 		 508 aa  217  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  29.26 
 
 		 478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  35.81 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  32.27 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  30.26 
 
 		 485 aa  200  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  31.39 
 
 		 483 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  31.36 
 
 		 479 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.89 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  32.88 
 
 		 491 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  30.84 
 
 		 485 aa  196  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  32.53 
 
 		 480 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  33.07 
 
 		 512 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  31.3 
 
 		 466 aa  191  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  32 
 
 		 482 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  31.54 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.91 
 
 		 524 aa  190  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  33.01 
 
 		 505 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  29.17 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  29.72 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  32.25 
 
 		 480 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  32.25 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  30.57 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  29.46 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  31.91 
 
 		 483 aa  183  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  29.35 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  28 
 
 		 483 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  31.22 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  32.35 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  30.99 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  31.02 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.09 
 
 		 481 aa  178  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  31.69 
 
 		 483 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  31.42 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  33.84 
 
 		 494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  31.59 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  27.65 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  31.42 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  32.82 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  27.18 
 
 		 485 aa  170  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  27.2 
 
 		 486 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  29.49 
 
 		 498 aa  170  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  30.64 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  29.87 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  31.58 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  30.25 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  28.21 
 
 		 502 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  30.11 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  29.46 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  30.49 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  31.16 
 
 		 482 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  30.08 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.07 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  29.6 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.07 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.38 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  31.87 
 
 		 483 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  32.01 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  29.95 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  29.22 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  29.08 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  30.6 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  30.62 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  31.83 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  29.95 
 
 		 485 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  34.13 
 
 		 478 aa  157  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  30.4 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  32.23 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  31.29 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  30.95 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  29.68 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.35 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  30.22 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  30.25 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  30.5 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  30.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  30.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  30.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  30.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  30.1 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  30.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  30.1 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  33.33 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  28.88 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  29.6 
 
 		 484 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.07 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  30.04 
 
 		 484 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.94 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  29.1 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  28.35 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  28.38 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  28.79 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  29.32 
 
 		 480 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  29.94 
 
 		 483 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>