270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1184 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  64.74 
 
 		 520 aa  640    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  100 
 
 		 512 aa  1012    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  63.3 
 
 		 514 aa  623  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  55.73 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  53.65 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  48.93 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  49.12 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  45.27 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  39.81 
 
 		 509 aa  388  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  41.29 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  40.94 
 
 		 483 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.7 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.66 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  40 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  40.12 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  35.98 
 
 		 524 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  40.62 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  37.57 
 
 		 479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.37 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  38.61 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  39.09 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  38.42 
 
 		 481 aa  293  7e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  37.82 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  39.53 
 
 		 483 aa  286  9e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  37.05 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  40.8 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  39.8 
 
 		 482 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.33 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.13 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  37.99 
 
 		 473 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  32.67 
 
 		 482 aa  269  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  37.5 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.77 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  34.87 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  34.95 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  32.74 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.22 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.58 
 
 		 498 aa  256  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  37.48 
 
 		 494 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.33 
 
 		 482 aa  253  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  35.28 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  35.84 
 
 		 491 aa  250  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.56 
 
 		 483 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  33.79 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  35.25 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  35.25 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  35.25 
 
 		 488 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  33.73 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  33.46 
 
 		 488 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.94 
 
 		 498 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.01 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  32.68 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  31.68 
 
 		 485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.18 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  36.75 
 
 		 485 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  31.32 
 
 		 485 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  34.4 
 
 		 488 aa  229  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  35.45 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  33.64 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  30.68 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  33.33 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  33.47 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  33.33 
 
 		 485 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  30.46 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  33.46 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  34.25 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  31.97 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.96 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  32.56 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  34.44 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  34.06 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  32.75 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  33.46 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  33.99 
 
 		 491 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  33.46 
 
 		 483 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  33.46 
 
 		 483 aa  220  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  34.97 
 
 		 483 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  33.66 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  33.66 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  33.66 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  33.66 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  33.66 
 
 		 483 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  34.45 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  33.4 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  33.86 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  34.45 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  33.98 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  34.65 
 
 		 483 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  35.39 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  34.45 
 
 		 483 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  34.45 
 
 		 483 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  32.93 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  33.27 
 
 		 483 aa  216  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  30.24 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>