258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0741 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  100 
 
 
480 aa  947    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  79.79 
 
 
480 aa  762    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  78.75 
 
 
480 aa  756    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  78.75 
 
 
480 aa  752    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  35.6 
 
 
467 aa  249  9e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  33.2 
 
 
493 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  32.45 
 
 
516 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  32.41 
 
 
485 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  31.54 
 
 
513 aa  206  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  32.35 
 
 
503 aa  203  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  29.88 
 
 
481 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  28.72 
 
 
508 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  32.7 
 
 
493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  29.4 
 
 
499 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  29.71 
 
 
503 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  30.35 
 
 
495 aa  180  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  29.94 
 
 
481 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  29.47 
 
 
483 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  28.41 
 
 
524 aa  177  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  32.08 
 
 
481 aa  177  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.95 
 
 
483 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  31.87 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  30.21 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  30.9 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  29.67 
 
 
482 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  29.56 
 
 
479 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  29.45 
 
 
498 aa  171  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  27.79 
 
 
478 aa  170  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  29.67 
 
 
481 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  29.31 
 
 
485 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  29.03 
 
 
479 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  30.1 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  29.74 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  30.8 
 
 
485 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  30.55 
 
 
514 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  26.29 
 
 
508 aa  160  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  29.26 
 
 
485 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  30.31 
 
 
480 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.59 
 
 
476 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.59 
 
 
480 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.45 
 
 
485 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  27.61 
 
 
506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.75 
 
 
484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  27.25 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  29.08 
 
 
482 aa  156  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  30.57 
 
 
480 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  29.69 
 
 
533 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  30.69 
 
 
486 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  28.61 
 
 
478 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  30.84 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  30.62 
 
 
485 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  30.62 
 
 
485 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  30.65 
 
 
486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  30.5 
 
 
485 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.5 
 
 
485 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  30.5 
 
 
485 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  30.5 
 
 
485 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  30.61 
 
 
485 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.54 
 
 
484 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  28.24 
 
 
484 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  26.95 
 
 
483 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  30.07 
 
 
485 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  26.91 
 
 
482 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  29.42 
 
 
487 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.03 
 
 
480 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  30.79 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  30.79 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.79 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  30.08 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  29.17 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  30.79 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  27.33 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  28.33 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.08 
 
 
480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  32.24 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  29.87 
 
 
480 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  24.9 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  27.9 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  27.88 
 
 
498 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  27.74 
 
 
484 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  26.92 
 
 
484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  31.78 
 
 
480 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  30.49 
 
 
485 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  30.28 
 
 
485 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.71 
 
 
494 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  27.88 
 
 
481 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  25.62 
 
 
491 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  26.92 
 
 
484 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  27.39 
 
 
483 aa  143  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  30.82 
 
 
485 aa  143  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.91 
 
 
480 aa  143  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  28.31 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  29.44 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.71 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.18 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  28.67 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  30.12 
 
 
485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  31.04 
 
 
483 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  30.75 
 
 
483 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  31.59 
 
 
511 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>