289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0240 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  100 
 
 
503 aa  1016    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  35.57 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.73 
 
 
508 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00720  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.86 
 
 
510 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  35.29 
 
 
498 aa  219  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  32.01 
 
 
493 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  29.37 
 
 
514 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  29.18 
 
 
467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  28.78 
 
 
479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  30.52 
 
 
513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  32.18 
 
 
516 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.83 
 
 
497 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  29.52 
 
 
480 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  27.52 
 
 
495 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  27.53 
 
 
499 aa  177  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  29.11 
 
 
480 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  29.31 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.82 
 
 
483 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  30.96 
 
 
480 aa  171  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  29.89 
 
 
478 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  29.28 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.67 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  27.99 
 
 
479 aa  160  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  28.83 
 
 
485 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  29.98 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  26.76 
 
 
481 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  26.38 
 
 
524 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  27.61 
 
 
485 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.5 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  26.92 
 
 
482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  25.48 
 
 
510 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  26.87 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  28.31 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  26.79 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  26.25 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  28.05 
 
 
482 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  26.94 
 
 
485 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.61 
 
 
494 aa  140  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.13 
 
 
481 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  26.67 
 
 
485 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  30.9 
 
 
533 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  25.6 
 
 
486 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  29.19 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  25.81 
 
 
482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  28.96 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  27.23 
 
 
491 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  26.03 
 
 
483 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  28.11 
 
 
481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  27.63 
 
 
512 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  30.34 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  28.05 
 
 
481 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  29.29 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  28.7 
 
 
474 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  27.2 
 
 
481 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  28.7 
 
 
485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  28.74 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  28.03 
 
 
500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  28.27 
 
 
486 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  28.63 
 
 
503 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  25.45 
 
 
483 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  24.9 
 
 
498 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  27.35 
 
 
509 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  25.76 
 
 
485 aa  129  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  26.06 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  25.68 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  26.36 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  24.44 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  25.31 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  28.94 
 
 
484 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.78 
 
 
484 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  27.09 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  27.92 
 
 
484 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  26.42 
 
 
483 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  27.7 
 
 
485 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  24.58 
 
 
482 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  26.42 
 
 
514 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  27.51 
 
 
484 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  27.63 
 
 
482 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  27.51 
 
 
484 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  27.51 
 
 
484 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  25.5 
 
 
520 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  26.65 
 
 
481 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  25.47 
 
 
484 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  25.65 
 
 
498 aa  123  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  27.32 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  27.61 
 
 
485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  26.39 
 
 
484 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  24.65 
 
 
485 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  28.2 
 
 
484 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  26.63 
 
 
488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  26.63 
 
 
488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  24.95 
 
 
502 aa  120  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  28.11 
 
 
484 aa  120  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  25.94 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  25.96 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  27.36 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  25.59 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  23.61 
 
 
514 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  27.03 
 
 
484 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  25.42 
 
 
491 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>