More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1935 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  100 
 
 		 485 aa  962    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  55 
 
 		 503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  51.96 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  47.93 
 
 		 508 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  40.66 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  32.75 
 
 		 516 aa  251  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  31.09 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  31.1 
 
 		 478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  32.18 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  32.47 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  32.61 
 
 		 533 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.35 
 
 		 479 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  32.2 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  33.1 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  32.27 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  32.87 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  32.87 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  31.33 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  28.07 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  30.74 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  32.05 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  29.34 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  31.24 
 
 		 481 aa  193  7e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  31.03 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  27.92 
 
 		 479 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  29.42 
 
 		 485 aa  189  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  28.72 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  29.71 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  29.55 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  28.66 
 
 		 483 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  28.57 
 
 		 483 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  28.99 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  33.26 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  30.2 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  30.82 
 
 		 483 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  28.63 
 
 		 510 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  30.89 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.91 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  32.58 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  29.01 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  27.9 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  29.01 
 
 		 484 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  30.7 
 
 		 495 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  27.93 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  28.93 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  28.19 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  27.93 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.22 
 
 		 524 aa  174  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  29.64 
 
 		 483 aa  173  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  30.08 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.18 
 
 		 483 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  29.4 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  30.08 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  27.02 
 
 		 482 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  29.88 
 
 		 484 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  27.36 
 
 		 486 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.87 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  29.43 
 
 		 498 aa  168  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.18 
 
 		 483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  28.52 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  29.09 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  30.61 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  30.25 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  28.89 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  29.85 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  27.11 
 
 		 485 aa  163  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  27.89 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  28.86 
 
 		 491 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  30.82 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  29.96 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  27.35 
 
 		 502 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  30.68 
 
 		 484 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  31.63 
 
 		 484 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  31.63 
 
 		 484 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  27.61 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  30.19 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  29.28 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  27.48 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  28.48 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.64 
 
 		 483 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  30.77 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  26.12 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  28.54 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  29.45 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  28.9 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  26.46 
 
 		 480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  28.57 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  29.43 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  30.9 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  29.57 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  29.55 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  28.5 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  30 
 
 		 495 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  28.57 
 
 		 506 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  29.36 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  27.75 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  34.1 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  30.07 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  29.8 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  28.22 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>