268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1060 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  100 
 
 		 495 aa  980    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  58.87 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  57.17 
 
 		 473 aa  485  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  39.92 
 
 		 479 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  39.47 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  36.19 
 
 		 524 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  40.21 
 
 		 502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.71 
 
 		 476 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  39.29 
 
 		 483 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  38.53 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  40.19 
 
 		 481 aa  302  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  38.64 
 
 		 516 aa  291  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  39.41 
 
 		 505 aa  289  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  36.65 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  37.24 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.88 
 
 		 491 aa  282  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  37.95 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  39.54 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  38.63 
 
 		 479 aa  276  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  36.82 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  36.34 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  34.93 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  40.18 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.32 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  39.22 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.18 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  36.26 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  37.76 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  38.88 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  35.65 
 
 		 481 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.16 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  37.82 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 484 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  37.04 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  36.44 
 
 		 482 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  36.34 
 
 		 484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  34.45 
 
 		 481 aa  259  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.72 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  34.37 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  36.93 
 
 		 480 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  37.12 
 
 		 484 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  36.83 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  34.99 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  37.35 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.18 
 
 		 485 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  37.35 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  35.16 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.16 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  34.56 
 
 		 520 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  34.99 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  34.85 
 
 		 483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  34.78 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  36.58 
 
 		 480 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.21 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  36.21 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  36.21 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  33.54 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  36.21 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  34.58 
 
 		 480 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  36.21 
 
 		 480 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.45 
 
 		 487 aa  249  7e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.56 
 
 		 481 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  33.63 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  36.05 
 
 		 480 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  38.19 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  38.87 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  34.39 
 
 		 484 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  34.39 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.12 
 
 		 483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  34.5 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  37.02 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  33.77 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  33.96 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  34.15 
 
 		 485 aa  243  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  35.28 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  33.96 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  35 
 
 		 481 aa  240  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.22 
 
 		 488 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  35.14 
 
 		 481 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.5 
 
 		 483 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  34.58 
 
 		 491 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.4 
 
 		 483 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  34.79 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  36.73 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.04 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.31 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  35.04 
 
 		 486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  37.47 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.73 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  35.63 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  30.5 
 
 		 485 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  32.79 
 
 		 485 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  32.51 
 
 		 484 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  36.64 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.07 
 
 		 483 aa  232  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  31.68 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  32.1 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  31.68 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  32.72 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>