278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3058 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  100 
 
 
506 aa  1011    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00720  Trk-type K+ transport system, membrane component  57.2 
 
 
510 aa  545  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  50.89 
 
 
508 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  35.57 
 
 
503 aa  286  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  30.61 
 
 
498 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  30.22 
 
 
499 aa  190  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  29.06 
 
 
495 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  29.98 
 
 
493 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  30 
 
 
479 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  29.74 
 
 
467 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.67 
 
 
497 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  32.32 
 
 
503 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  27.54 
 
 
514 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  27.4 
 
 
480 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.12 
 
 
513 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  29.44 
 
 
486 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  27.59 
 
 
480 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  30.39 
 
 
485 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  28.57 
 
 
485 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  28.63 
 
 
483 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  27.72 
 
 
480 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  26.99 
 
 
480 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  28.69 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  29.8 
 
 
516 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.93 
 
 
480 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  29.11 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  28.39 
 
 
466 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  31.82 
 
 
484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  26.69 
 
 
479 aa  140  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  26.96 
 
 
482 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  25.64 
 
 
510 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.7 
 
 
524 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  25.15 
 
 
485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  28.97 
 
 
483 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  29.78 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  25.37 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  25.77 
 
 
485 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  28.77 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  28.77 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  27.99 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  29.56 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  30.18 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  28.25 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  30.22 
 
 
485 aa  134  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.11 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  28.12 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  29.05 
 
 
481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.5 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  27.33 
 
 
481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  26.4 
 
 
485 aa  130  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  27.98 
 
 
482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  28.03 
 
 
488 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  29.11 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  27.5 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  27.52 
 
 
482 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  27.82 
 
 
482 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  28.64 
 
 
488 aa  126  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  27.25 
 
 
484 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.66 
 
 
494 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  25.49 
 
 
493 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  27.69 
 
 
484 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  27.04 
 
 
498 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  26.47 
 
 
484 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  28.14 
 
 
484 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  26.61 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  27.44 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  30.21 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  26.73 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  29.45 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  29.28 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  28.12 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  25.46 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.04 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  26.26 
 
 
485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  27.9 
 
 
486 aa  120  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  28.66 
 
 
481 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  27.86 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  25.3 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  28.18 
 
 
494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  25.55 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  28.97 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  29.35 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  28.25 
 
 
483 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  28.74 
 
 
484 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  28.23 
 
 
481 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  28.92 
 
 
491 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  26.02 
 
 
485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  28.7 
 
 
533 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  26.05 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  28.46 
 
 
490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  28.09 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  25.96 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  30.5 
 
 
498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  24.74 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  27.82 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  26.14 
 
 
486 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  27.29 
 
 
505 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  27.17 
 
 
491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  25.77 
 
 
487 aa  113  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  26.09 
 
 
474 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>