More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2080 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  100 
 
 
516 aa  1020    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  73.89 
 
 
513 aa  739    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  42.46 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  41.48 
 
 
533 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  35.62 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  32.75 
 
 
485 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  32.09 
 
 
479 aa  226  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  30.71 
 
 
478 aa  217  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  33.33 
 
 
481 aa  206  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  33.49 
 
 
503 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  30.27 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  33.71 
 
 
512 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  29.08 
 
 
508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  30.93 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  32.03 
 
 
483 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  30.59 
 
 
485 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  32.6 
 
 
497 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  33.48 
 
 
480 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  33.12 
 
 
482 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  31.15 
 
 
476 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  32.45 
 
 
480 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  33.19 
 
 
494 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  33.48 
 
 
480 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  29.74 
 
 
493 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  32.42 
 
 
491 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  29.53 
 
 
485 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  33.48 
 
 
480 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  31.43 
 
 
491 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  29.44 
 
 
466 aa  183  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  32.79 
 
 
481 aa  183  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  31.95 
 
 
503 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  29.48 
 
 
502 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  32.36 
 
 
505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  30.36 
 
 
477 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  29.3 
 
 
524 aa  179  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  31.34 
 
 
482 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  30.47 
 
 
499 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  27.57 
 
 
485 aa  178  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  32.04 
 
 
485 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  32.76 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  27.84 
 
 
483 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  29.35 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  30.96 
 
 
482 aa  174  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  29.79 
 
 
483 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  29 
 
 
509 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  30.39 
 
 
482 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  31.49 
 
 
484 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  30.38 
 
 
495 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  31.12 
 
 
514 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  32.58 
 
 
481 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  31.65 
 
 
479 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  29.22 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  30.25 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  30.75 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  32.22 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  29.96 
 
 
487 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.63 
 
 
483 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  30.75 
 
 
485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  29.7 
 
 
512 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.38 
 
 
480 aa  162  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  28.89 
 
 
520 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  29.18 
 
 
510 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  30.93 
 
 
514 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  28.43 
 
 
484 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  28.17 
 
 
485 aa  159  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  30.19 
 
 
483 aa  159  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  28.78 
 
 
484 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  30.19 
 
 
485 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  30.47 
 
 
485 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  30.32 
 
 
482 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  31.11 
 
 
483 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.29 
 
 
483 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  28.01 
 
 
482 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  27.79 
 
 
486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  28.54 
 
 
488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  27.84 
 
 
483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  28.98 
 
 
484 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.88 
 
 
484 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  30.45 
 
 
488 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  29.18 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  30.45 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  32.53 
 
 
478 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  30.48 
 
 
484 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  28.63 
 
 
485 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  27.84 
 
 
498 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.8 
 
 
481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  32.25 
 
 
483 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  29.83 
 
 
484 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  29.82 
 
 
481 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  29.5 
 
 
484 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  29.15 
 
 
486 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  27.45 
 
 
480 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  30 
 
 
483 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  27.39 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  27.83 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  29.93 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  29.93 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  29.93 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  29.93 
 
 
483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  29.87 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>