249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0675 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  96.25 
 
 		 480 aa  902    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  100 
 
 		 480 aa  954    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  78.75 
 
 		 480 aa  758    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  97.29 
 
 		 480 aa  905    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  35.76 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  33.48 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  32.12 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  33.1 
 
 		 485 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  31.59 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  32.49 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  32 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  28.75 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  28.34 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  29.32 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  28.39 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.77 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  30.61 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  28.27 
 
 		 481 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  32.22 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  29.55 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  30.87 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.27 
 
 		 483 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  28.42 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  29.14 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  28.06 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.36 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.57 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.34 
 
 		 524 aa  166  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  27.98 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  29.74 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.64 
 
 		 497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.89 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  29.4 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  30.21 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  28.99 
 
 		 481 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.4 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  29.96 
 
 		 514 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  30.6 
 
 		 533 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  27.29 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.04 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  28.36 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  27.05 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  30.11 
 
 		 477 aa  156  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  27.72 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  30 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  31.91 
 
 		 511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  29.59 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  29.17 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  29.85 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.25 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  26.8 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  28.2 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.14 
 
 		 484 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  30.66 
 
 		 484 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  27.56 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  29.26 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  26.07 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  27.27 
 
 		 487 aa  147  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00720  Trk-type K+ transport system, membrane component  29.52 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  30.96 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  27.03 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  29.09 
 
 		 486 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  29.87 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  29.87 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  29.87 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  29.87 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  27.03 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  28.48 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  27.53 
 
 		 487 aa  144  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.71 
 
 		 484 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  26.84 
 
 		 484 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.2 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  27.47 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  29.2 
 
 		 480 aa  143  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  27.05 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  28.99 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  26.8 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  27.79 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  27.23 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  27.64 
 
 		 486 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  28.15 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  28.96 
 
 		 480 aa  140  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  25.42 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  29.24 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.27 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  27.75 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  29.24 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  28.06 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  25.24 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  28.47 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  27.1 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  25.32 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  27.89 
 
 		 485 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  27.89 
 
 		 485 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  27.89 
 
 		 485 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  27.83 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  26.51 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  24.9 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  23.6 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  27.67 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>