More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0548 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  100 
 
 		 485 aa  964    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.81 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.52 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  32.54 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  33.5 
 
 		 467 aa  212  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  32.99 
 
 		 482 aa  199  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  28.87 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  30.28 
 
 		 485 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  29.05 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  31.26 
 
 		 491 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3914  cation transporter  32.76 
 
 		 491 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.847036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  30.6 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  32.27 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  31.97 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  31.76 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  30.59 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.29 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  31.07 
 
 		 485 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  30.2 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.52 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  29.33 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  28.12 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  29.14 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  29.93 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  26.67 
 
 		 513 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  29.4 
 
 		 533 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  27.98 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  32.71 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  29.93 
 
 		 474 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  29.93 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.34 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  31.58 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.47 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  28.88 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  33.49 
 
 		 497 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  27.48 
 
 		 483 aa  170  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  29.51 
 
 		 485 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  29.83 
 
 		 486 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  29.68 
 
 		 487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  28.81 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  26.6 
 
 		 481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.37 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  30.82 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  26.19 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  27.93 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  27.65 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  28.02 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  30.23 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  26.83 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  30.62 
 
 		 495 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  30.43 
 
 		 477 aa  163  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  26.43 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1639  cation transporter  35.78 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.855726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  29.92 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  32.83 
 
 		 511 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  25.73 
 
 		 481 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  29.16 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  31.92 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  28.31 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  26.78 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  29.16 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  25.87 
 
 		 484 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  27.05 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  28.46 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  28.46 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  28.46 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  28.46 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  28.46 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  29.11 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  28.07 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  30.57 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  28.13 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  32.39 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  25.76 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  27.51 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  30.33 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  30.33 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  30.33 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.33 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.58 
 
 		 481 aa  154  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  28.07 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  28 
 
 		 485 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  29.79 
 
 		 481 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  30.43 
 
 		 485 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  25.42 
 
 		 480 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  25.64 
 
 		 484 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  153  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  30.8 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  28.16 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  26.33 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  29.52 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  25.64 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0311  Trk-type K+ transport system, membrane component  30.21 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.766234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  31.04 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  28.16 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>