265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1687 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  100 
 
 		 498 aa  1004    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  53.27 
 
 		 493 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  45.21 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  44.47 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  39.61 
 
 		 514 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  38.67 
 
 		 497 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  32.42 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  35.29 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  36.43 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  27.31 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  29.93 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  29.28 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  31.96 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  30.4 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  29.31 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  27.36 
 
 		 466 aa  176  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  30.59 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  30.61 
 
 		 506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  29.71 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  30.56 
 
 		 494 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  29.19 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  29.93 
 
 		 485 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  29.25 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  29.39 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  30.4 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  28.33 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  28.7 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  30.9 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  28.7 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  28.51 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  28.92 
 
 		 484 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  30.68 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  30.56 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.17 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  28.92 
 
 		 479 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  27.44 
 
 		 484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  28.7 
 
 		 484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  29.18 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  32.22 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  29.94 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  27.5 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  29.8 
 
 		 487 aa  163  6e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.66 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  29.31 
 
 		 484 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  31.67 
 
 		 511 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.55 
 
 		 480 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  29.76 
 
 		 480 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  27.15 
 
 		 485 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  27.59 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  30.87 
 
 		 480 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  31.54 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  29.88 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  30.98 
 
 		 513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  31.51 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  29.8 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  28.91 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  28.24 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  27.58 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  24.79 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  25.82 
 
 		 481 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  28.38 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  27.42 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  29.75 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.6 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  29.43 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  24.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  28.98 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  26.04 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  29.4 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  29.3 
 
 		 480 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  29.83 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  28.51 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  25.97 
 
 		 482 aa  147  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.15 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  28.9 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  24.74 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  27.8 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  26.88 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  28.9 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  28.9 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  28.9 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  25.41 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  26.78 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  27.58 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  25 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  26.78 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.43 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  30.51 
 
 		 486 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  26.74 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  29.14 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  29.05 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3914  cation transporter  30.24 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.847036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  28.1 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  28.84 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  25.76 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.05 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.16 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  27.29 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  28.74 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  29.5 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>