More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3914 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3914  cation transporter  100 
 
 		 491 aa  947    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.847036 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  31.85 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  26.72 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  27.27 
 
 		 478 aa  143  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  30.24 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1639  cation transporter  33.33 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.855726  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  31.97 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  29.28 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  29.61 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  29.31 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  29.84 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  29.17 
 
 		 498 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  31.04 
 
 		 495 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  30.97 
 
 		 497 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  28.11 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  25.32 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  27.48 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  28.9 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  28.61 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  28.93 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  28.61 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  28.72 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  28.68 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  30.54 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  25.52 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  30.1 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  28.04 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  28.19 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  29.41 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  25 
 
 		 485 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  27.15 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  28.15 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  28.36 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  28.71 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  28.04 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  27.85 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  24.68 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  29.02 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  28.2 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  26.32 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  25.73 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  27.34 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.7 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  27.93 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  27.93 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  26.79 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  26.74 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  29.19 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  28.64 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  27.54 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  27.9 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  26.67 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  28.47 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  28.81 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  28.03 
 
 		 488 aa  100  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  30.24 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  28.09 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  27.86 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  25.7 
 
 		 482 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  30.39 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  27.36 
 
 		 476 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  28.39 
 
 		 491 aa  97.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  26.79 
 
 		 485 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  27.2 
 
 		 480 aa  96.7  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  26.61 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  26.8 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  26.8 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  28.4 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  27.29 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  30.5 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  26.15 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  27.49 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  27.39 
 
 		 482 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  27.59 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  31.5 
 
 		 481 aa  94.7  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  26.87 
 
 		 480 aa  94.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  27.86 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.16 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  26.65 
 
 		 482 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  26.65 
 
 		 482 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  28.02 
 
 		 484 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  31.04 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  25.87 
 
 		 480 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.07 
 
 		 483 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  24.94 
 
 		 485 aa  93.6  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  25.81 
 
 		 481 aa  93.6  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  25.87 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  27.95 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.33 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  25.87 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  25.46 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  26.8 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  25.78 
 
 		 485 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  26.07 
 
 		 485 aa  90.1  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  26.22 
 
 		 482 aa  90.1  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  26.77 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  29.61 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  26.32 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  25.62 
 
 		 480 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  24.79 
 
 		 481 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>