More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1639 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1639  cation transporter  100 
 
 		 469 aa  911    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.855726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  35.78 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3914  cation transporter  33.92 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.847036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  32.2 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.78 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  31.28 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  31.96 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  28.11 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  31.96 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  28.78 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  28.6 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  26.82 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  30.94 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.12 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  29.03 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  31.7 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  32.05 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  29.5 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  32.05 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  30.34 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  28.64 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  29.49 
 
 		 510 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  25.27 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  30.33 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  30.29 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  31.92 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  30.36 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  28 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  31.44 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  28.18 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  28.18 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  28.18 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  28.18 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  28 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  26.24 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  27.55 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  31.21 
 
 		 484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  29.1 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  28.09 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  30.97 
 
 		 484 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  28.07 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  28.1 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  29.41 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  30.18 
 
 		 486 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  29.03 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  28.64 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  29.29 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  27.48 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  27.07 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  26.91 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  31.38 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.1 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  28.91 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  28.67 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  26.45 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  28.94 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  29.14 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  27.13 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  28.44 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  26.68 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  27.55 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  30 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  29.81 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  27.5 
 
 		 480 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  25.33 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  28.74 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  28.02 
 
 		 509 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  29.29 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.46 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  32.06 
 
 		 533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  27.97 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  30.38 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  34.75 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  28.96 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  29.9 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  29.14 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.02 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  28.29 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  29.35 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  28.29 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  29.9 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  28.47 
 
 		 485 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.46 
 
 		 524 aa  113  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  26.28 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  28.28 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  30.21 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  29.02 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.32 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  27.74 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  27.65 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  31.09 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  27.52 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  29.35 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  29.37 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  27 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.74 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  27.62 
 
 		 499 aa  107  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  28.99 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  28.05 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  26.27 
 
 		 482 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>