242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0172 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  100 
 
 		 493 aa  989    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  40.66 
 
 		 485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  41.05 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  38.89 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  35.98 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  33.07 
 
 		 480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.28 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  32.15 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.44 
 
 		 513 aa  203  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  33.33 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  32.08 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  28.6 
 
 		 479 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  33.06 
 
 		 480 aa  200  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  29.9 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  30.12 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  27.39 
 
 		 479 aa  183  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  28 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  30.41 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  30.06 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  30.02 
 
 		 481 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  33.18 
 
 		 481 aa  177  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  28.84 
 
 		 481 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  30.73 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  32.7 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  32.7 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  28.48 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  28.54 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  29.9 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  28.03 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  28.6 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  29.58 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  28.57 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  29.27 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  28.5 
 
 		 485 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  29.73 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  30.32 
 
 		 466 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  30.41 
 
 		 482 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  31.28 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  28.61 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  31.03 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  31.03 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  28.36 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  29.47 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  27.57 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  31.3 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  28 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  28.42 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.96 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.31 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  27.31 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  29.53 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  27.93 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  31.58 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  28.25 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  28.37 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  27.89 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  28.78 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  29.8 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  30.73 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  30.73 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  30.73 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  30.73 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  30.92 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.42 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  25.05 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  26.02 
 
 		 477 aa  146  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  29.21 
 
 		 485 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  28.54 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  29.36 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  29.36 
 
 		 466 aa  143  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  26.67 
 
 		 484 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  26.32 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  27.6 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  28.42 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  30.7 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  30.39 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  25.6 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  28.19 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  30.48 
 
 		 505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  27.6 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  27.76 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  26.32 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  29.06 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  30.81 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  30.77 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.43 
 
 		 484 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  27.94 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  29.02 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  26.13 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  29.37 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  26.61 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  26.64 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  27.49 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  26.33 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  28.33 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  26.79 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  29.61 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  25.83 
 
 		 514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>