More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4119 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  100 
 
 
511 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  42.46 
 
 
516 aa  358  9e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  41.26 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  34.99 
 
 
533 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  36.73 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  32.47 
 
 
485 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  30.53 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  29.22 
 
 
508 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  32.86 
 
 
485 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  30.02 
 
 
479 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  31.94 
 
 
493 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  31.67 
 
 
498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  31.47 
 
 
503 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  28.51 
 
 
479 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  31.92 
 
 
491 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  29.22 
 
 
478 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  31.58 
 
 
514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  34.79 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  30.89 
 
 
476 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  32.1 
 
 
495 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  31.19 
 
 
481 aa  177  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  28.3 
 
 
466 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  28.86 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  30.72 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  31.06 
 
 
481 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  30.52 
 
 
480 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  31.86 
 
 
497 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  30.66 
 
 
481 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  33.59 
 
 
524 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  30.52 
 
 
480 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  28.99 
 
 
514 aa  170  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  29.54 
 
 
483 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  31.19 
 
 
480 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  27.74 
 
 
510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  30.34 
 
 
503 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  27.97 
 
 
502 aa  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  27.64 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  29.21 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  33.07 
 
 
478 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  28.77 
 
 
481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  29.96 
 
 
505 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  28.3 
 
 
509 aa  163  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  29.83 
 
 
514 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.29 
 
 
483 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  28.97 
 
 
477 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  29.28 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  32.56 
 
 
483 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  30.39 
 
 
480 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  30.92 
 
 
486 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3914  cation transporter  29.84 
 
 
491 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.847036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  30.71 
 
 
481 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  29.49 
 
 
495 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  31.56 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  31.32 
 
 
485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  27.31 
 
 
498 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  25.8 
 
 
483 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  31.36 
 
 
486 aa  147  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  28.19 
 
 
483 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.06 
 
 
483 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  30.4 
 
 
485 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  30.24 
 
 
481 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  27.68 
 
 
481 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  28.08 
 
 
485 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  29.6 
 
 
473 aa  143  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  29.05 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  28.57 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  26.96 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  28.31 
 
 
487 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  30.73 
 
 
482 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  27.57 
 
 
482 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.04 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  29.72 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.43 
 
 
480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  28.8 
 
 
480 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.76 
 
 
480 aa  140  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  26.79 
 
 
516 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  28.34 
 
 
482 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  32.56 
 
 
484 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  30.75 
 
 
481 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  27.77 
 
 
494 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  28.14 
 
 
484 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  29 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  28.6 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  28.86 
 
 
488 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  29 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  26.86 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  29 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  29 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  29 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.5 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  27.22 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  29.96 
 
 
512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  28.7 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  28.7 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  28.02 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  28.37 
 
 
484 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  28.72 
 
 
480 aa  134  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  27.87 
 
 
481 aa  133  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  28.6 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  29.51 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>