More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2084 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  100 
 
 		 485 aa  955    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  51.96 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  44.1 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  46.01 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  38.89 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.65 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.98 
 
 		 513 aa  210  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  30.43 
 
 		 479 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  30.12 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  30.98 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  31.07 
 
 		 485 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  29.81 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  30.33 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  29 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  28.36 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  26.54 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  30.23 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  27.95 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  29.44 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  29.63 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.6 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  30.8 
 
 		 481 aa  166  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  28.06 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  30.72 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  29.88 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  27.86 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  28.43 
 
 		 499 aa  162  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  28.57 
 
 		 483 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  28.6 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  29.48 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  31.89 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  28.9 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  27.94 
 
 		 480 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  30.12 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  27.69 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  30.12 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  31.18 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  30.79 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  25.81 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  25.81 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  30.27 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  28.22 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  28.95 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  28.88 
 
 		 487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  27.72 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  27.07 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  26 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  27.31 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  27.21 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  27.79 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  26.54 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  28.66 
 
 		 476 aa  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  28.69 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  26.76 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  29.53 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  30.65 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  27.36 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  26.28 
 
 		 486 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  26.7 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  26.88 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  29.59 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  30.09 
 
 		 478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  26.65 
 
 		 503 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  26.45 
 
 		 498 aa  146  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  31.19 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  29.09 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  27.16 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  26 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  27.19 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  32.07 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  25.16 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  29.22 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  29.83 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  29.3 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  29.05 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.14 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  28.33 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  29.42 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  27.17 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  25.87 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  28.32 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  26.82 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  27.03 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  29.27 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  28.85 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  26.87 
 
 		 510 aa  140  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  27.73 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  27.73 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  27.73 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  28.85 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  28.85 
 
 		 484 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  27.44 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  28.23 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  27.93 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  27.73 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  28.34 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  27.74 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  28.71 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  28.05 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  29.28 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>