294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1260 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  100 
 
 		 493 aa  975    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  53.27 
 
 		 498 aa  531  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  53.58 
 
 		 495 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  53.17 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  43.13 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  41.2 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  37.03 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  32.44 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  30.77 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.57 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  29.73 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  30.08 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  33.18 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  30.5 
 
 		 482 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  33.06 
 
 		 477 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  27.44 
 
 		 481 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  29.55 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  28.96 
 
 		 494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  32.43 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  28.83 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  30.53 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  32.49 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  29.34 
 
 		 485 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  29.55 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  27.48 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  32.02 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.43 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  28.36 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  31.43 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  32.51 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.25 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  27.69 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  27.47 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  31.41 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  29.34 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  31.32 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  26.96 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.47 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  28.69 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  31.94 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.85 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  27.69 
 
 		 481 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  31.73 
 
 		 480 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  30.17 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  28.36 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  31.38 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  27.53 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  29.49 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  27.47 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  31.13 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  29.77 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  30.47 
 
 		 483 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  32.79 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  26.81 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  29.92 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  32.97 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  27.25 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  27.96 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  29.16 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  30.79 
 
 		 485 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  29.39 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  27.48 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  30.04 
 
 		 481 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  29.18 
 
 		 483 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  28.32 
 
 		 483 aa  160  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  27.7 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  27.78 
 
 		 508 aa  158  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  28.13 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  27.78 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  28.83 
 
 		 481 aa  156  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  30.41 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  28.51 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  27.86 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  27.22 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  28.46 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  28.27 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  26.81 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  27.8 
 
 		 483 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  26.99 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  28.84 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  26.14 
 
 		 482 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  27.67 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  28.37 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  25.69 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  28.94 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  27.39 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  25.63 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  27.59 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  28.94 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  26.76 
 
 		 485 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  27.39 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  28.57 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  29.16 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  28.84 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  29.27 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  28.67 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  28.81 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  28.84 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  26.86 
 
 		 485 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  28.42 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>