295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00720  Trk-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 
510 aa  1016    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  57.2 
 
 
506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01400  Trk-type K+ transport system, membrane component  46.84 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  33.2 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  29.84 
 
 
513 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  27.59 
 
 
479 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  28.22 
 
 
481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  27.98 
 
 
498 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  29.67 
 
 
480 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  29.25 
 
 
480 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  26.69 
 
 
493 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  26.89 
 
 
499 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  29.05 
 
 
480 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  29.94 
 
 
480 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  30.15 
 
 
516 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  30.09 
 
 
467 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  25.92 
 
 
495 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  27.99 
 
 
479 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  29.74 
 
 
485 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  26.92 
 
 
483 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  26.98 
 
 
514 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  26.41 
 
 
485 aa  143  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  25.82 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  28.29 
 
 
498 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  27.93 
 
 
482 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  27.82 
 
 
482 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  29.5 
 
 
497 aa  137  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  28 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  23.78 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  26.36 
 
 
524 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  26.92 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  26.56 
 
 
482 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.57 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  29.58 
 
 
533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  28.41 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  29.33 
 
 
480 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  27.82 
 
 
483 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  25.61 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  27.88 
 
 
483 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  26.03 
 
 
508 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  28.36 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  25.36 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  29.83 
 
 
484 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  25.2 
 
 
485 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  28.4 
 
 
488 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  29.89 
 
 
484 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  26.6 
 
 
510 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  27.33 
 
 
485 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  27.76 
 
 
488 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  29.44 
 
 
484 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  28.57 
 
 
484 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  26.48 
 
 
481 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  29.44 
 
 
484 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  28.17 
 
 
485 aa  123  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  27.86 
 
 
485 aa  123  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  28.71 
 
 
485 aa  123  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  27.24 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  27.7 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  29.84 
 
 
503 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  28.17 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  29.41 
 
 
494 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  27.17 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  26.6 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  27.35 
 
 
484 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  27.44 
 
 
488 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  27.24 
 
 
484 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  27.29 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  24.64 
 
 
479 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  27.55 
 
 
484 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  25.87 
 
 
483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  27.38 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  29.49 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  25.46 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  27.11 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  26.93 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  26.96 
 
 
484 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  27.82 
 
 
480 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  27.14 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  28.16 
 
 
476 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  28.11 
 
 
484 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  28.38 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  26.25 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  26.59 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  27.51 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  24.07 
 
 
483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  29.02 
 
 
483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  27.79 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  25.05 
 
 
481 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  27.11 
 
 
483 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  25.3 
 
 
481 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  25.49 
 
 
486 aa  109  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  27.27 
 
 
485 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  26.08 
 
 
485 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  28.68 
 
 
505 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  27.11 
 
 
484 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  28.46 
 
 
483 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  25.6 
 
 
482 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  25.75 
 
 
482 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  25.75 
 
 
482 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  26.69 
 
 
482 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>