More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1332 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  76.64 
 
 		 139 aa  223  6e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  69.78 
 
 		 139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  70.07 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  45.22 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  41.38 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  40.16 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  38.98 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  39.83 
 
 		 614 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  39.32 
 
 		 625 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  38.58 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  43.12 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  37.21 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  40.87 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.83 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  37.4 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  42.74 
 
 		 624 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34.65 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  41.18 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.19 
 
 		 605 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 618 aa  77.4  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 623 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 688 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  38.14 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 		 615 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  37.29 
 
 		 615 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  33.59 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  40.98 
 
 		 638 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 		 618 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  40 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  39.84 
 
 		 606 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  41.44 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  39.84 
 
 		 606 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  37.6 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 688 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  35.61 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  38.66 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 		 639 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  34.68 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  36.63 
 
 		 622 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 689 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  37.7 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  35.94 
 
 		 646 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  40.35 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 		 606 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  37.29 
 
 		 615 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  36.5 
 
 		 629 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.28 
 
 		 625 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  35.94 
 
 		 641 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.35 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  40.35 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  38.98 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 615 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.29 
 
 		 688 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  35.66 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 620 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  34.75 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  39.37 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  36.13 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  40.34 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  36.44 
 
 		 615 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  35.04 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  35.59 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.75 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  39.47 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  37.29 
 
 		 606 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  35.82 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  32.8 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  36.51 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  37.29 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>