More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1251 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  40.15 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  37.72 
 
 		 637 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.17 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  41.32 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 		 618 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  34.68 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  35.4 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  37.19 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  34.71 
 
 		 627 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.15 
 
 		 626 aa  67.8  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.2 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0317  putative signal transduction protein with CBS domains  28.21 
 
 		 730 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  33.65 
 
 		 574 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  34.91 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 		 688 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.48 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 		 623 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  25.62 
 
 		 688 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 		 688 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  25.98 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.53 
 
 		 606 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  36.21 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  34.78 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  29.75 
 
 		 625 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  33.59 
 
 		 628 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  26.56 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  30.63 
 
 		 601 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  29.84 
 
 		 637 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  28.93 
 
 		 641 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  36.84 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  31.62 
 
 		 636 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 605 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.16 
 
 		 600 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  32.79 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 574 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.36 
 
 		 613 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 		 615 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  36.51 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  27.19 
 
 		 643 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.57 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 598 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 611 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.9 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  39.22 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.82 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  35.78 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  31.68 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.33 
 
 		 1560 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.91 
 
 		 605 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2680  signal-transduction protein  38.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0686487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.33 
 
 		 916 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  31.37 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  29.73 
 
 		 622 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 615 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>