155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2679 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2680  signal-transduction protein  42.28 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0686487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  32.06 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  30.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.05 
 
 		 600 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  26.77 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  29.92 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  30.08 
 
 		 325 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.09 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  27.42 
 
 		 353 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  25.33 
 
 		 241 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.58 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  28.15 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1884  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  25 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  30.47 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  23.85 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  23.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  30.33 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  27.5 
 
 		 307 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  25.32 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.27 
 
 		 963 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  25.52 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  23.2 
 
 		 300 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  24.82 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  21.95 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  22.13 
 
 		 333 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1489  CBS  27.34 
 
 		 239 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  23.33 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  23.77 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  22.13 
 
 		 359 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  27.78 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  25.2 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  25.2 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.06 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  23.84 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  28 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  22.63 
 
 		 644 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  25 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  23 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  27.87 
 
 		 366 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  24.81 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  23.49 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  24.67 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  23.77 
 
 		 513 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  29.13 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  24.41 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.08 
 
 		 498 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  30.25 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  28.18 
 
 		 636 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  23.7 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  22.96 
 
 		 427 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  26.67 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  28.33 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  26.67 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  25.74 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.39 
 
 		 633 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  22.33 
 
 		 381 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  26.06 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  24.37 
 
 		 490 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  29.41 
 
 		 338 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  22.37 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  30.95 
 
 		 332 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  27.82 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  22.67 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  27.2 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 		 641 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  22.22 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  26.62 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  26.4 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  23.01 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  24.41 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  31.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  22.13 
 
 		 513 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  23.58 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>