More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1489 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1489  CBS  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  45.57 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  44.44 
 
 
153 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  43.79 
 
 
151 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  43.79 
 
 
151 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  43.51 
 
 
151 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  43.14 
 
 
148 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  42.86 
 
 
151 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  43.14 
 
 
151 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1679  CBS domain containing protein  42.48 
 
 
146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  41.56 
 
 
151 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0857  CBS  42.95 
 
 
149 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20755e-23  unclonable  0.0000000599831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  43.42 
 
 
149 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  43.71 
 
 
151 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  43.14 
 
 
154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  42.21 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  43.71 
 
 
154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
151 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  43.05 
 
 
151 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  43.05 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  43.05 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  43.05 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
154 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3779  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 
146 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
151 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 
155 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  39.49 
 
 
150 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2047  CBS domain containing protein  39.87 
 
 
151 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1657  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 
151 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3571  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.21 
 
 
473 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3300  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  72.73 
 
 
474 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.13 
 
 
486 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3951  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  72.73 
 
 
474 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372135  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.13 
 
 
486 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4750  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.21 
 
 
477 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.21 
 
 
475 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  72.31 
 
 
475 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4544  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.21 
 
 
474 aa  92  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80 
 
 
474 aa  91.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.64 
 
 
491 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.64 
 
 
478 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.64 
 
 
478 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0954  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  72.73 
 
 
201 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.64 
 
 
488 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.64 
 
 
488 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.64 
 
 
489 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.64 
 
 
477 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.64 
 
 
476 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  71.64 
 
 
490 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.64 
 
 
478 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  71.64 
 
 
486 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  81.82 
 
 
489 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3798  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  78.18 
 
 
474 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0338  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  78.18 
 
 
474 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  81.82 
 
 
487 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6083  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  83.33 
 
 
490 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  71.21 
 
 
455 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  71.21 
 
 
455 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  70.15 
 
 
484 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  70.15 
 
 
484 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  70.15 
 
 
478 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2826  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  70.15 
 
 
491 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0309139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  31.79 
 
 
144 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  68.66 
 
 
478 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
478 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01840  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  65.67 
 
 
477 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0883663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.66 
 
 
484 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  67.16 
 
 
484 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67.16 
 
 
484 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.66 
 
 
483 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  50 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.66 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50 
 
 
466 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2884  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.33 
 
 
466 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  78.18 
 
 
607 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.33 
 
 
466 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  67.16 
 
 
484 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  50 
 
 
465 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.33 
 
 
466 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1950  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.69 
 
 
468 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0105538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  53.33 
 
 
466 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50 
 
 
466 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.33 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>